Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIIAD1A6NNX1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIIAD1A6NNX1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIIAD1A6NNX1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIIAD1A6NNX1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIIAD1A6NNX1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIIAD1A6NNX1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIIAD1A6NNX1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIIAD1A6NNX1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIIAD1A6NNX1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIIAD1A6NNX1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIIAD1A6NNX1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIIAD1A6NNX1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIIAD1A6NNX1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIIAD1A6NNX1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIIAD1A6NNX1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIIAD1A6NNX1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIIAD1A6NNX1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIIAD1A6NNX1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIIAD1A6NNX1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIIAD1A6NNX1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIIAD1A6NNX1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIIAD1A6NNX1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIIAD1A6NNX1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIIAD1A6NNX1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RIIAD1A6NNX1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIIAD1A6NNX1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIIAD1A6NNX1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIIAD1A6NNX1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIIAD1A6NNX1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIIAD1A6NNX1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIIAD1A6NNX1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RIIAD1A6NNX1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIIAD1A6NNX1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIIAD1A6NNX1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIIAD1A6NNX1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIIAD1A6NNX1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIIAD1A6NNX1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIIAD1A6NNX1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIIAD1A6NNX1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIIAD1A6NNX1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIIAD1A6NNX1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIIAD1A6NNX1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIIAD1A6NNX1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIIAD1A6NNX1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIIAD1A6NNX1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIIAD1A6NNX1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIIAD1A6NNX1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIIAD1A6NNX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIIAD1A6NNX1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIIAD1A6NNX1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIIAD1A6NNX1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIIAD1A6NNX1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIIAD1A6NNX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIIAD1A6NNX1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIIAD1A6NNX1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIIAD1A6NNX1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIIAD1A6NNX1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIIAD1A6NNX1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIIAD1A6NNX1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIIAD1A6NNX1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIIAD1A6NNX1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIIAD1A6NNX1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIIAD1A6NNX1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RIIAD1A6NNX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIIAD1A6NNX1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIIAD1A6NNX1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIIAD1A6NNX1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIIAD1A6NNX1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIIAD1A6NNX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms