Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN24A6NM45 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN24A6NM45 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN24A6NM45 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN24A6NM45 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN24A6NM45 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN24A6NM45 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN24A6NM45 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN24A6NM45 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN24A6NM45 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN24A6NM45 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN24A6NM45 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN24A6NM45 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN24A6NM45 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN24A6NM45 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN24A6NM45 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN24A6NM45 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN24A6NM45 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN24A6NM45 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN24A6NM45 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN24A6NM45 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN24A6NM45 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN24A6NM45 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN24A6NM45 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN24A6NM45 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN24A6NM45 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN24A6NM45 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN24A6NM45 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN24A6NM45 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN24A6NM45 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN24A6NM45 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN24A6NM45 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN24A6NM45 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN24A6NM45 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN24A6NM45 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN24A6NM45 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN24A6NM45 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN24A6NM45 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN24A6NM45 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN24A6NM45 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN24A6NM45 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN24A6NM45 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN24A6NM45 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN24A6NM45 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN24A6NM45 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN24A6NM45 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN24A6NM45 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN24A6NM45 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN24A6NM45 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN24A6NM45 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN24A6NM45 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN24A6NM45 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN24A6NM45 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN24A6NM45 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN24A6NM45 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN24A6NM45 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN24A6NM45 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms