Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF25A6NGN4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF25A6NGN4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF25A6NGN4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF25A6NGN4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF25A6NGN4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF25A6NGN4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF25A6NGN4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF25A6NGN4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF25A6NGN4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF25A6NGN4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF25A6NGN4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF25A6NGN4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF25A6NGN4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF25A6NGN4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF25A6NGN4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF25A6NGN4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF25A6NGN4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF25A6NGN4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF25A6NGN4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF25A6NGN4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF25A6NGN4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF25A6NGN4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF25A6NGN4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF25A6NGN4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF25A6NGN4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF25A6NGN4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF25A6NGN4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF25A6NGN4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF25A6NGN4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF25A6NGN4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF25A6NGN4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF25A6NGN4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF25A6NGN4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF25A6NGN4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF25A6NGN4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF25A6NGN4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF25A6NGN4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF25A6NGN4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF25A6NGN4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF25A6NGN4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF25A6NGN4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF25A6NGN4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF25A6NGN4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF25A6NGN4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF25A6NGN4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF25A6NGN4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF25A6NGN4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF25A6NGN4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF25A6NGN4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF25A6NGN4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF25A6NGN4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF25A6NGN4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF25A6NGN4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF25A6NGN4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF25A6NGN4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEF25A6NGN4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF25A6NGN4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF25A6NGN4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF25A6NGN4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF25A6NGN4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF25A6NGN4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF25A6NGN4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF25A6NGN4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF25A6NGN4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF25A6NGN4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF25A6NGN4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF25A6NGN4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF25A6NGN4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF25A6NGN4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF25A6NGN4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF25A6NGN4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF25A6NGN4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF25A6NGN4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF25A6NGN4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRAMEF25A6NGN4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF25A6NGN4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF25A6NGN4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF25A6NGN4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF25A6NGN4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF25A6NGN4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF25A6NGN4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF25A6NGN4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF25A6NGN4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF25A6NGN4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms