Protein–RNA interactions for Protein: A6BM72

MEGF11, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF11A6BM72 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEGF11A6BM72 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEGF11A6BM72 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEGF11A6BM72 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEGF11A6BM72 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEGF11A6BM72 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEGF11A6BM72 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEGF11A6BM72 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MEGF11A6BM72 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEGF11A6BM72 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEGF11A6BM72 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEGF11A6BM72 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEGF11A6BM72 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEGF11A6BM72 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEGF11A6BM72 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEGF11A6BM72 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEGF11A6BM72 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEGF11A6BM72 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEGF11A6BM72 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEGF11A6BM72 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MEGF11A6BM72 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEGF11A6BM72 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEGF11A6BM72 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEGF11A6BM72 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEGF11A6BM72 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEGF11A6BM72 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEGF11A6BM72 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEGF11A6BM72 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEGF11A6BM72 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEGF11A6BM72 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEGF11A6BM72 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEGF11A6BM72 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEGF11A6BM72 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEGF11A6BM72 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEGF11A6BM72 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEGF11A6BM72 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEGF11A6BM72 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MEGF11A6BM72 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEGF11A6BM72 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEGF11A6BM72 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEGF11A6BM72 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEGF11A6BM72 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEGF11A6BM72 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEGF11A6BM72 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEGF11A6BM72 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEGF11A6BM72 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEGF11A6BM72 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEGF11A6BM72 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEGF11A6BM72 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEGF11A6BM72 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEGF11A6BM72 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEGF11A6BM72 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEGF11A6BM72 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MEGF11A6BM72 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEGF11A6BM72 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEGF11A6BM72 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEGF11A6BM72 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEGF11A6BM72 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEGF11A6BM72 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEGF11A6BM72 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEGF11A6BM72 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEGF11A6BM72 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEGF11A6BM72 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEGF11A6BM72 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEGF11A6BM72 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEGF11A6BM72 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms