Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A0A0U1RRA0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
A0A0U1RRA0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A0A0U1RRA0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A0A0U1RRA0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A0A0U1RRA0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A0A0U1RRA0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RRA0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RRA0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RRA0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RRA0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RRA0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RRA0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RRA0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RRA0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RRA0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RRA0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A0A0U1RRA0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A0A0U1RRA0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A0A0U1RRA0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
A0A0U1RRA0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
A0A0U1RRA0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RRA0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RRA0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RRA0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0U1RRA0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0U1RRA0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A0A0U1RRA0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RRA0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms