Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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