Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H8

IGKV1D-42, Immunoglobulin kappa variable 1D-42 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-42A0A075B6H8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGKV1D-42A0A075B6H8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGKV1D-42A0A075B6H8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGKV1D-42A0A075B6H8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IGKV1D-42A0A075B6H8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGKV1D-42A0A075B6H8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGKV1D-42A0A075B6H8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGKV1D-42A0A075B6H8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGKV1D-42A0A075B6H8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IGKV1D-42A0A075B6H8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGKV1D-42A0A075B6H8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGKV1D-42A0A075B6H8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGKV1D-42A0A075B6H8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGKV1D-42A0A075B6H8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGKV1D-42A0A075B6H8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGKV1D-42A0A075B6H8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGKV1D-42A0A075B6H8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGKV1D-42A0A075B6H8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGKV1D-42A0A075B6H8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGKV1D-42A0A075B6H8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGKV1D-42A0A075B6H8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGKV1D-42A0A075B6H8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGKV1D-42A0A075B6H8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGKV1D-42A0A075B6H8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGKV1D-42A0A075B6H8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGKV1D-42A0A075B6H8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGKV1D-42A0A075B6H8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGKV1D-42A0A075B6H8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGKV1D-42A0A075B6H8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGKV1D-42A0A075B6H8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGKV1D-42A0A075B6H8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGKV1D-42A0A075B6H8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGKV1D-42A0A075B6H8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGKV1D-42A0A075B6H8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGKV1D-42A0A075B6H8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGKV1D-42A0A075B6H8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGKV1D-42A0A075B6H8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGKV1D-42A0A075B6H8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGKV1D-42A0A075B6H8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGKV1D-42A0A075B6H8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGKV1D-42A0A075B6H8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGKV1D-42A0A075B6H8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGKV1D-42A0A075B6H8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGKV1D-42A0A075B6H8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGKV1D-42A0A075B6H8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGKV1D-42A0A075B6H8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGKV1D-42A0A075B6H8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGKV1D-42A0A075B6H8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGKV1D-42A0A075B6H8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGKV1D-42A0A075B6H8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGKV1D-42A0A075B6H8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGKV1D-42A0A075B6H8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGKV1D-42A0A075B6H8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGKV1D-42A0A075B6H8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGKV1D-42A0A075B6H8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGKV1D-42A0A075B6H8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGKV1D-42A0A075B6H8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGKV1D-42A0A075B6H8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGKV1D-42A0A075B6H8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGKV1D-42A0A075B6H8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGKV1D-42A0A075B6H8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGKV1D-42A0A075B6H8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGKV1D-42A0A075B6H8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGKV1D-42A0A075B6H8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGKV1D-42A0A075B6H8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV1D-42A0A075B6H8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms