Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS25Q9BRG1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms