Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSANTD3Q96H12 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD3Q96H12 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms