RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312221.9

SLC22A18-201, Transcript of solute carrier family 22 member 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A18, Length 1,628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A18-201ENST00000312221 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.91■■■■■ 6.06
SLC22A18-201ENST00000312221 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.22■■■■■ 4.99
SLC22A18-201ENST00000312221 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
SLC22A18-201ENST00000312221 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.81■■■■■ 4.6
SLC22A18-201ENST00000312221 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.45■■■■■ 4.55
SLC22A18-201ENST00000312221 ABCC9O60706 1549 aa43.42■■■■■ 4.54
SLC22A18-201ENST00000312221 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.25■■■■■ 4.51
SLC22A18-201ENST00000312221 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.13■■■■■ 4.49
SLC22A18-201ENST00000312221 NACADO15069 1562 aa42.94■■■■■ 4.46
SLC22A18-201ENST00000312221 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.55■■■■■ 4.4
SLC22A18-201ENST00000312221 SCRIBQ14160 1630 aa42.43■■■■■ 4.38
SLC22A18-201ENST00000312221 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.77■■■■■ 4.28
SLC22A18-201ENST00000312221 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.23
SLC22A18-201ENST00000312221 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.23■■■■■ 4.19
SLC22A18-201ENST00000312221 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
SLC22A18-201ENST00000312221 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.04■■■■■ 4.16
SLC22A18-201ENST00000312221 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
SLC22A18-201ENST00000312221 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.86■■■■■ 4.137e-7■■■■□ 25.6
SLC22A18-201ENST00000312221 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.86■■■■■ 4.13
SLC22A18-201ENST00000312221 SMARCA4P51532 1647 aa40.7■■■■■ 4.11
SLC22A18-201ENST00000312221 WIZO95785 1651 aa40.57■■■■■ 4.09
SLC22A18-201ENST00000312221 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.21■■■■■ 4.03
SLC22A18-201ENST00000312221 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
SLC22A18-201ENST00000312221 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
SLC22A18-201ENST00000312221 SMARCA2P51531 1590 aa39.98■■■■□ 3.99
SLC22A18-201ENST00000312221 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.93■■■■□ 3.98
SLC22A18-201ENST00000312221 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.82■■■■□ 3.96
SLC22A18-201ENST00000312221 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
SLC22A18-201ENST00000312221 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.69■■■■□ 3.94
SLC22A18-201ENST00000312221 HMGXB3Q12766 1538 aa39.62■■■■□ 3.93
SLC22A18-201ENST00000312221 NCAPD3P42695 1498 aa39.56■■■■□ 3.92
SLC22A18-201ENST00000312221 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.36■■■■□ 3.89
SLC22A18-201ENST00000312221 TRIM41Q8WV44 630 aa39.05■■■■□ 3.84
SLC22A18-201ENST00000312221 ABCC8Q09428 1581 aa38.93■■■■□ 3.82
SLC22A18-201ENST00000312221 PRDM2Q13029 1718 aa38.74■■■■□ 3.79
SLC22A18-201ENST00000312221 CFTRP13569 1480 aa38.73■■■■□ 3.79
SLC22A18-201ENST00000312221 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.65■■■■□ 3.78
SLC22A18-201ENST00000312221 SYNJ1O43426 1573 aa38.54■■■■□ 3.76
SLC22A18-201ENST00000312221 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.53■■■■□ 3.76
SLC22A18-201ENST00000312221 TOP2BQ02880 1626 aa38.4■■■■□ 3.74
SLC22A18-201ENST00000312221 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.39■■■■□ 3.74
SLC22A18-201ENST00000312221 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
SLC22A18-201ENST00000312221 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.28■■■■□ 3.72
SLC22A18-201ENST00000312221 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.23■■■■□ 3.71
SLC22A18-201ENST00000312221 CUX1P39880 1505 aa38.22■■■■□ 3.71
SLC22A18-201ENST00000312221 EEA1Q15075 1411 aa38.21■■■■□ 3.71
SLC22A18-201ENST00000312221 SOGA1O94964 1423 aa38.16■■■■□ 3.7
SLC22A18-201ENST00000312221 NESP48681 1621 aa38.16■■■■□ 3.7
SLC22A18-201ENST00000312221 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.15■■■■□ 3.7
SLC22A18-201ENST00000312221 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.12■■■■□ 3.69
SLC22A18-201ENST00000312221 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.99■■■■□ 3.67
SLC22A18-201ENST00000312221 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.93■■■■□ 3.66
SLC22A18-201ENST00000312221 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.91■■■■□ 3.66
SLC22A18-201ENST00000312221 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.89■■■■□ 3.66
SLC22A18-201ENST00000312221 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.85■■■■□ 3.65
SLC22A18-201ENST00000312221 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.82■■■■□ 3.65
SLC22A18-201ENST00000312221 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.78■■■■□ 3.64
SLC22A18-201ENST00000312221 TOPBP1Q92547 1522 aa37.77■■■■□ 3.64
SLC22A18-201ENST00000312221 KIF21BO75037 1637 aa37.76■■■■□ 3.63
SLC22A18-201ENST00000312221 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.71■■■■□ 3.63
SLC22A18-201ENST00000312221 GOLGA3Q08378 1498 aa37.68■■■■□ 3.62
SLC22A18-201ENST00000312221 KIF27Q86VH2 1401 aa37.67■■■■□ 3.62
SLC22A18-201ENST00000312221 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
SLC22A18-201ENST00000312221 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
SLC22A18-201ENST00000312221 CUX2O14529 1486 aa37.54■■■■□ 3.6
SLC22A18-201ENST00000312221 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.53■■■■□ 3.6
SLC22A18-201ENST00000312221 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.47■■■■□ 3.59
SLC22A18-201ENST00000312221 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.47■■■■□ 3.59
SLC22A18-201ENST00000312221 PRXQ9BXM0 1461 aa37.45■■■■□ 3.59
SLC22A18-201ENST00000312221 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.45■■■■□ 3.59
SLC22A18-201ENST00000312221 WDR97A6NE52 1622 aa37.44■■■■□ 3.58
SLC22A18-201ENST00000312221 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.42■■■■□ 3.58
SLC22A18-201ENST00000312221 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.41■■■■□ 3.58
SLC22A18-201ENST00000312221 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
SLC22A18-201ENST00000312221 CEP162Q5TB80 1403 aa37.36■■■■□ 3.57
SLC22A18-201ENST00000312221 WDR62O43379 1518 aa37.28■■■■□ 3.56
SLC22A18-201ENST00000312221 ERCC6Q03468 1493 aa37.26■■■■□ 3.55
SLC22A18-201ENST00000312221 IGF1RP08069 1367 aa37.25■■■■□ 3.55
SLC22A18-201ENST00000312221 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
SLC22A18-201ENST00000312221 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.21■■■■□ 3.55
SLC22A18-201ENST00000312221 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
SLC22A18-201ENST00000312221 CUL7Q14999 1698 aa37.14■■■■□ 3.54
SLC22A18-201ENST00000312221 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.09■■■■□ 3.53
SLC22A18-201ENST00000312221 CLIP1P30622 1438 aa37.04■■■■□ 3.52
SLC22A18-201ENST00000312221 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.04■■■■□ 3.52
SLC22A18-201ENST00000312221 IFT140Q96RY7 1462 aa37■■■■□ 3.51
SLC22A18-201ENST00000312221 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
SLC22A18-201ENST00000312221 PBRM1Q86U86 1689 aa36.95■■■■□ 3.51
SLC22A18-201ENST00000312221 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.77■■■■□ 3.48
SLC22A18-201ENST00000312221 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.77■■■■□ 3.481e-7■■■■■ 32.3
SLC22A18-201ENST00000312221 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.76■■■■□ 3.47
SLC22A18-201ENST00000312221 GRIN2BQ13224 1484 aa36.75■■■■□ 3.47
SLC22A18-201ENST00000312221 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
SLC22A18-201ENST00000312221 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
SLC22A18-201ENST00000312221 ADAMTS12P58397 1594 aa36.73■■■■□ 3.47
SLC22A18-201ENST00000312221 ARAP1Q96P48 1450 aa36.69■■■■□ 3.46
SLC22A18-201ENST00000312221 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
SLC22A18-201ENST00000312221 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
SLC22A18-201ENST00000312221 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.65■■■■□ 3.46
SLC22A18-201ENST00000312221 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.64■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms