Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF578Q96N58 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF578Q96N58 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms