Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF113AO15541 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF113AO15541 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF113AO15541 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RNF113AO15541 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF113AO15541 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF113AO15541 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF113AO15541 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF113AO15541 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF113AO15541 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF113AO15541 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF113AO15541 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF113AO15541 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF113AO15541 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF113AO15541 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF113AO15541 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF113AO15541 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF113AO15541 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF113AO15541 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF113AO15541 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF113AO15541 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF113AO15541 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF113AO15541 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF113AO15541 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF113AO15541 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF113AO15541 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF113AO15541 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF113AO15541 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF113AO15541 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF113AO15541 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RNF113AO15541 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF113AO15541 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF113AO15541 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RNF113AO15541 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RNF113AO15541 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF113AO15541 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms