RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503045.5

TSPAN17-204, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN17, Length 1,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-204ENST00000503045 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.65■■■■■ 6.66
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TSPAN17-204ENST00000503045 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.81■■■■■ 5.24
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TSPAN17-204ENST00000503045 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.28■■■■■ 5.16
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TSPAN17-204ENST00000503045 SMARCA2P51531 1590 aa43.87■■■■■ 4.61
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TSPAN17-204ENST00000503045 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.63■■■■■ 4.58
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TSPAN17-204ENST00000503045 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.14■■■■■ 4.34
TSPAN17-204ENST00000503045 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.13■■■■■ 4.34
TSPAN17-204ENST00000503045 PRDM2Q13029 1718 aa42.11■■■■■ 4.33
TSPAN17-204ENST00000503045 WDR62O43379 1518 aa42.1■■■■■ 4.33
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TSPAN17-204ENST00000503045 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
TSPAN17-204ENST00000503045 TOPBP1Q92547 1522 aa41.44■■■■■ 4.22
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TSPAN17-204ENST00000503045 ABCC8Q09428 1581 aa41.41■■■■■ 4.22
TSPAN17-204ENST00000503045 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.39■■■■■ 4.22
TSPAN17-204ENST00000503045 IFT140Q96RY7 1462 aa41.27■■■■■ 4.2
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TSPAN17-204ENST00000503045 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.83■■■■■ 4.13
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TSPAN17-204ENST00000503045 WDR97A6NE52 1622 aa40.76■■■■■ 4.12
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TSPAN17-204ENST00000503045 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
TSPAN17-204ENST00000503045 CHD1O14646 1710 aa40.59■■■■■ 4.09
TSPAN17-204ENST00000503045 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.58■■■■■ 4.09
TSPAN17-204ENST00000503045 TOP2BQ02880 1626 aa40.55■■■■■ 4.08
TSPAN17-204ENST00000503045 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.51■■■■■ 4.08
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TSPAN17-204ENST00000503045 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.49■■■■■ 4.07
TSPAN17-204ENST00000503045 GRIN2BQ13224 1484 aa40.44■■■■■ 4.06
TSPAN17-204ENST00000503045 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.44■■■■■ 4.06
TSPAN17-204ENST00000503045 PBRM1Q86U86 1689 aa40.43■■■■■ 4.06
TSPAN17-204ENST00000503045 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.42■■■■■ 4.06
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TSPAN17-204ENST00000503045 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.28■■■■■ 4.04
TSPAN17-204ENST00000503045 FBLN2P98095 1184 aa40.28■■■■■ 4.04
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TSPAN17-204ENST00000503045 ARHGEF11O15085 1522 aa40.21■■■■■ 4.03
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TSPAN17-204ENST00000503045 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
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TSPAN17-204ENST00000503045 ARAP1Q96P48 1450 aa39.86■■■■□ 3.97
TSPAN17-204ENST00000503045 NUP160Q12769 1436 aa39.79■■■■□ 3.96
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TSPAN17-204ENST00000503045 KIF27Q86VH2 1401 aa39.7■■■■□ 3.95
TSPAN17-204ENST00000503045 CUL7Q14999 1698 aa39.61■■■■□ 3.93
TSPAN17-204ENST00000503045 SHROOM2Q13796 1616 aa39.6■■■■□ 3.93
TSPAN17-204ENST00000503045 IGF1RP08069 1367 aa39.56■■■■□ 3.92
TSPAN17-204ENST00000503045 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.49■■■■□ 3.91
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TSPAN17-204ENST00000503045 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.32■■■■□ 3.88
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