RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640382.1

TCEA1-214, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TCEA1, Length 1,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-214ENST00000640382 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.84■■■■■ 6.85
TCEA1-214ENST00000640382 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.92■■■■■ 5.9
TCEA1-214ENST00000640382 ABCC9O60706 1549 aa51.91■■■■■ 5.9
TCEA1-214ENST00000640382 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.42■■■■■ 5.5
TCEA1-214ENST00000640382 NACADO15069 1562 aa49.1■■■■■ 5.45
TCEA1-214ENST00000640382 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.77■■■■■ 5.4
TCEA1-214ENST00000640382 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.74■■■■■ 5.39
TCEA1-214ENST00000640382 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.45■■■■■ 5.35
TCEA1-214ENST00000640382 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.32■■■■■ 5.33
TCEA1-214ENST00000640382 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.31■■■■■ 5.32
TCEA1-214ENST00000640382 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.01■■■■■ 5.28
TCEA1-214ENST00000640382 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.93■■■■■ 5.26
TCEA1-214ENST00000640382 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.81■■■■■ 5.24
TCEA1-214ENST00000640382 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.39■■■■■ 5.18
TCEA1-214ENST00000640382 SCRIBQ14160 1630 aa47.27■■■■■ 5.16
TCEA1-214ENST00000640382 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.92■■■■■ 5.1
TCEA1-214ENST00000640382 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.81■■■■■ 5.08
TCEA1-214ENST00000640382 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.79■■■■■ 5.08
TCEA1-214ENST00000640382 NCAPD3P42695 1498 aa45.35■■■■■ 4.85
TCEA1-214ENST00000640382 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.18■■■■■ 4.82
TCEA1-214ENST00000640382 SMARCA4P51532 1647 aa45.12■■■■■ 4.81
TCEA1-214ENST00000640382 SMARCA2P51531 1590 aa45.05■■■■■ 4.8
TCEA1-214ENST00000640382 HMGXB3Q12766 1538 aa44.99■■■■■ 4.79
TCEA1-214ENST00000640382 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.88■■■■■ 4.78
TCEA1-214ENST00000640382 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.82■■■■■ 4.77
TCEA1-214ENST00000640382 ERCC6Q03468 1493 aa44.82■■■■■ 4.77
TCEA1-214ENST00000640382 CUX2O14529 1486 aa44.8■■■■■ 4.76
TCEA1-214ENST00000640382 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.72■■■■■ 4.75
TCEA1-214ENST00000640382 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
TCEA1-214ENST00000640382 NESP48681 1621 aa44.6■■■■■ 4.73
TCEA1-214ENST00000640382 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.56■■■■■ 4.72
TCEA1-214ENST00000640382 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.3■■■■■ 4.68
TCEA1-214ENST00000640382 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
TCEA1-214ENST00000640382 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.04■■■■■ 4.64
TCEA1-214ENST00000640382 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.02■■■■■ 4.64
TCEA1-214ENST00000640382 WIZO95785 1651 aa44■■■■■ 4.63
TCEA1-214ENST00000640382 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.94■■■■■ 4.63
TCEA1-214ENST00000640382 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.67■■■■■ 4.58
TCEA1-214ENST00000640382 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
TCEA1-214ENST00000640382 WDR62O43379 1518 aa43.58■■■■■ 4.57
TCEA1-214ENST00000640382 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.47■■■■■ 4.55
TCEA1-214ENST00000640382 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
TCEA1-214ENST00000640382 CFTRP13569 1480 aa43.45■■■■■ 4.55
TCEA1-214ENST00000640382 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.43■■■■■ 4.54
TCEA1-214ENST00000640382 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
TCEA1-214ENST00000640382 PRDM2Q13029 1718 aa42.99■■■■■ 4.47
TCEA1-214ENST00000640382 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.98■■■■■ 4.47
TCEA1-214ENST00000640382 TRIM41Q8WV44 630 aa42.76■■■■■ 4.44
TCEA1-214ENST00000640382 OSCARQ8IYS5 282 aa42.73■■■■■ 4.43
TCEA1-214ENST00000640382 IFT140Q96RY7 1462 aa42.62■■■■■ 4.41
TCEA1-214ENST00000640382 TOPBP1Q92547 1522 aa42.61■■■■■ 4.41
TCEA1-214ENST00000640382 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
TCEA1-214ENST00000640382 ABCC8Q09428 1581 aa42.52■■■■■ 4.4
TCEA1-214ENST00000640382 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.45■■■■■ 4.39
TCEA1-214ENST00000640382 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
TCEA1-214ENST00000640382 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
TCEA1-214ENST00000640382 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
TCEA1-214ENST00000640382 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.17■■■■■ 4.34
TCEA1-214ENST00000640382 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.17■■■■■ 4.34
TCEA1-214ENST00000640382 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.17■■■■■ 4.34
TCEA1-214ENST00000640382 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.16■■■■■ 4.344e-8■■■■□ 23.2
TCEA1-214ENST00000640382 ARHGEF11O15085 1522 aa42.05■■■■■ 4.32
TCEA1-214ENST00000640382 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.01■■■■■ 4.32
TCEA1-214ENST00000640382 CHD1O14646 1710 aa41.99■■■■■ 4.31
TCEA1-214ENST00000640382 SOGA1O94964 1423 aa41.97■■■■■ 4.31
TCEA1-214ENST00000640382 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.9■■■■■ 4.3
TCEA1-214ENST00000640382 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.3
TCEA1-214ENST00000640382 CUX1P39880 1505 aa41.87■■■■■ 4.29
TCEA1-214ENST00000640382 FBLN2P98095 1184 aa41.84■■■■■ 4.29
TCEA1-214ENST00000640382 WDR97A6NE52 1622 aa41.83■■■■■ 4.29
TCEA1-214ENST00000640382 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.72■■■■■ 4.27
TCEA1-214ENST00000640382 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.71■■■■■ 4.27
TCEA1-214ENST00000640382 ARAP1Q96P48 1450 aa41.64■■■■■ 4.26
TCEA1-214ENST00000640382 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
TCEA1-214ENST00000640382 GRIN2BQ13224 1484 aa41.62■■■■■ 4.25
TCEA1-214ENST00000640382 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
TCEA1-214ENST00000640382 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
TCEA1-214ENST00000640382 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.54■■■■■ 4.24
TCEA1-214ENST00000640382 SYNJ2O15056 1496 aa41.49■■■■■ 4.23
TCEA1-214ENST00000640382 SYNJ1O43426 1573 aa41.49■■■■■ 4.23
TCEA1-214ENST00000640382 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.47■■■■■ 4.23
TCEA1-214ENST00000640382 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.44■■■■■ 4.23
TCEA1-214ENST00000640382 PBRM1Q86U86 1689 aa41.43■■■■■ 4.22
TCEA1-214ENST00000640382 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.38■■■■■ 4.21
TCEA1-214ENST00000640382 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.25■■■■■ 4.19
TCEA1-214ENST00000640382 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
TCEA1-214ENST00000640382 TOP2BQ02880 1626 aa41.18■■■■■ 4.18
TCEA1-214ENST00000640382 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.18■■■■■ 4.18
TCEA1-214ENST00000640382 GRIN2AQ12879 1464 aa41.09■■■■■ 4.17
TCEA1-214ENST00000640382 ADAMTS12P58397 1594 aa41.06■■■■■ 4.16
TCEA1-214ENST00000640382 NUP160Q12769 1436 aa40.98■■■■■ 4.15
TCEA1-214ENST00000640382 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.95■■■■■ 4.15
TCEA1-214ENST00000640382 CEP170Q5SW79 1584 aa40.94■■■■■ 4.14
TCEA1-214ENST00000640382 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.92■■■■■ 4.14
TCEA1-214ENST00000640382 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.88■■■■■ 4.13
TCEA1-214ENST00000640382 SHROOM2Q13796 1616 aa40.79■■■■■ 4.12
TCEA1-214ENST00000640382 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
TCEA1-214ENST00000640382 JPH4Q96JJ6 628 aa40.53■■■■■ 4.08
TCEA1-214ENST00000640382 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.47■■■■■ 4.07
TCEA1-214ENST00000640382 IGF1RP08069 1367 aa40.39■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms