RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426877.2

TRAPPC5-202, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC5, Length 765 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-202ENST00000426877 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.74■■■■■ 6.83
TRAPPC5-202ENST00000426877 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.81■■■■■ 5.88
TRAPPC5-202ENST00000426877 ABCC9O60706 1549 aa51.54■■■■■ 5.84
TRAPPC5-202ENST00000426877 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.2■■■■■ 5.47
TRAPPC5-202ENST00000426877 NACADO15069 1562 aa48.92■■■■■ 5.42
TRAPPC5-202ENST00000426877 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.48■■■■■ 5.35
TRAPPC5-202ENST00000426877 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.36■■■■■ 5.33
TRAPPC5-202ENST00000426877 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.19■■■■■ 5.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.08■■■■■ 5.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.95■■■■■ 5.27
TRAPPC5-202ENST00000426877 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
TRAPPC5-202ENST00000426877 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.77■■■■■ 5.24
TRAPPC5-202ENST00000426877 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.77■■■■■ 5.24
TRAPPC5-202ENST00000426877 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.24■■■■■ 5.15
TRAPPC5-202ENST00000426877 SCRIBQ14160 1630 aa47.13■■■■■ 5.14
TRAPPC5-202ENST00000426877 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.61■■■■■ 5.05
TRAPPC5-202ENST00000426877 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.58■■■■■ 5.05
TRAPPC5-202ENST00000426877 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.45■■■■■ 5.03
TRAPPC5-202ENST00000426877 NCAPD3P42695 1498 aa45.15■■■■■ 4.82
TRAPPC5-202ENST00000426877 SMARCA4P51532 1647 aa45.02■■■■■ 4.8
TRAPPC5-202ENST00000426877 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.02■■■■■ 4.8
TRAPPC5-202ENST00000426877 SMARCA2P51531 1590 aa44.93■■■■■ 4.78
TRAPPC5-202ENST00000426877 HMGXB3Q12766 1538 aa44.86■■■■■ 4.77
TRAPPC5-202ENST00000426877 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
TRAPPC5-202ENST00000426877 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.64■■■■■ 4.74
TRAPPC5-202ENST00000426877 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
TRAPPC5-202ENST00000426877 ERCC6Q03468 1493 aa44.51■■■■■ 4.72
TRAPPC5-202ENST00000426877 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.47■■■■■ 4.71
TRAPPC5-202ENST00000426877 CUX2O14529 1486 aa44.46■■■■■ 4.71
TRAPPC5-202ENST00000426877 NESP48681 1621 aa44.33■■■■■ 4.69
TRAPPC5-202ENST00000426877 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.18■■■■■ 4.66
TRAPPC5-202ENST00000426877 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.12■■■■■ 4.65
TRAPPC5-202ENST00000426877 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
TRAPPC5-202ENST00000426877 WIZO95785 1651 aa43.93■■■■■ 4.62
TRAPPC5-202ENST00000426877 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.82■■■■■ 4.61
TRAPPC5-202ENST00000426877 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.8■■■■■ 4.6
TRAPPC5-202ENST00000426877 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.76■■■■■ 4.6
TRAPPC5-202ENST00000426877 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
TRAPPC5-202ENST00000426877 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.45■■■■■ 4.55
TRAPPC5-202ENST00000426877 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
TRAPPC5-202ENST00000426877 WDR62O43379 1518 aa43.38■■■■■ 4.53
TRAPPC5-202ENST00000426877 CFTRP13569 1480 aa43.32■■■■■ 4.52
TRAPPC5-202ENST00000426877 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.31■■■■■ 4.52
TRAPPC5-202ENST00000426877 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.25■■■■■ 4.51
TRAPPC5-202ENST00000426877 PRDM2Q13029 1718 aa42.91■■■■■ 4.46
TRAPPC5-202ENST00000426877 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
TRAPPC5-202ENST00000426877 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.89■■■■■ 4.46
TRAPPC5-202ENST00000426877 TOPBP1Q92547 1522 aa42.46■■■■■ 4.39
TRAPPC5-202ENST00000426877 IFT140Q96RY7 1462 aa42.44■■■■■ 4.38
TRAPPC5-202ENST00000426877 ABCC8Q09428 1581 aa42.4■■■■■ 4.38
TRAPPC5-202ENST00000426877 OSCARQ8IYS5 282 aa42.35■■■■■ 4.37
TRAPPC5-202ENST00000426877 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.34■■■■■ 4.37
TRAPPC5-202ENST00000426877 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
TRAPPC5-202ENST00000426877 TRIM41Q8WV44 630 aa42.22■■■■■ 4.35
TRAPPC5-202ENST00000426877 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
TRAPPC5-202ENST00000426877 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
TRAPPC5-202ENST00000426877 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
TRAPPC5-202ENST00000426877 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.93■■■■■ 4.3
TRAPPC5-202ENST00000426877 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.84■■■■■ 4.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.84■■■■■ 4.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.84■■■■■ 4.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.84■■■■■ 4.29
TRAPPC5-202ENST00000426877 SOGA1O94964 1423 aa41.81■■■■■ 4.28
TRAPPC5-202ENST00000426877 CUX1P39880 1505 aa41.79■■■■■ 4.28
TRAPPC5-202ENST00000426877 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.79■■■■■ 4.28
TRAPPC5-202ENST00000426877 CHD1O14646 1710 aa41.77■■■■■ 4.28
TRAPPC5-202ENST00000426877 WDR97A6NE52 1622 aa41.74■■■■■ 4.27
TRAPPC5-202ENST00000426877 ARHGEF11O15085 1522 aa41.74■■■■■ 4.27
TRAPPC5-202ENST00000426877 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
TRAPPC5-202ENST00000426877 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
TRAPPC5-202ENST00000426877 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.55■■■■■ 4.24
TRAPPC5-202ENST00000426877 FBLN2P98095 1184 aa41.55■■■■■ 4.24
TRAPPC5-202ENST00000426877 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
TRAPPC5-202ENST00000426877 GRIN2BQ13224 1484 aa41.47■■■■■ 4.23
TRAPPC5-202ENST00000426877 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.36■■■■■ 4.21
TRAPPC5-202ENST00000426877 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.34■■■■■ 4.21
TRAPPC5-202ENST00000426877 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.34■■■■■ 4.21
TRAPPC5-202ENST00000426877 ARAP1Q96P48 1450 aa41.34■■■■■ 4.21
TRAPPC5-202ENST00000426877 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
TRAPPC5-202ENST00000426877 SYNJ2O15056 1496 aa41.33■■■■■ 4.21
TRAPPC5-202ENST00000426877 PBRM1Q86U86 1689 aa41.33■■■■■ 4.21
TRAPPC5-202ENST00000426877 SYNJ1O43426 1573 aa41.31■■■■■ 4.2
TRAPPC5-202ENST00000426877 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.31■■■■■ 4.2
TRAPPC5-202ENST00000426877 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.29■■■■■ 4.2
TRAPPC5-202ENST00000426877 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.18
TRAPPC5-202ENST00000426877 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.18■■■■■ 4.18
TRAPPC5-202ENST00000426877 TOP2BQ02880 1626 aa41.18■■■■■ 4.18
TRAPPC5-202ENST00000426877 ADAMTS12P58397 1594 aa40.97■■■■■ 4.15
TRAPPC5-202ENST00000426877 GRIN2AQ12879 1464 aa40.95■■■■■ 4.15
TRAPPC5-202ENST00000426877 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.85■■■■■ 4.13
TRAPPC5-202ENST00000426877 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.83■■■■■ 4.13
TRAPPC5-202ENST00000426877 NUP160Q12769 1436 aa40.83■■■■■ 4.13
TRAPPC5-202ENST00000426877 CEP170Q5SW79 1584 aa40.79■■■■■ 4.12
TRAPPC5-202ENST00000426877 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
TRAPPC5-202ENST00000426877 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.65■■■■■ 4.1
TRAPPC5-202ENST00000426877 SHROOM2Q13796 1616 aa40.64■■■■■ 4.1
TRAPPC5-202ENST00000426877 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.39■■■■■ 4.06
TRAPPC5-202ENST00000426877 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
TRAPPC5-202ENST00000426877 KIF27Q86VH2 1401 aa40.34■■■■■ 4.05
TRAPPC5-202ENST00000426877 JPH4Q96JJ6 628 aa40.32■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms