Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1EQ9GZS1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms