Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ZCCHC17Q9NP64 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms