Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms