RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308344.9

CLDN15-201, Transcript of claudin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN15, Length 1,370 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15-201ENST00000308344 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.52■■■■■ 6.64
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CLDN15-201ENST00000308344 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.62■■■■■ 5.21
CLDN15-201ENST00000308344 NACADO15069 1562 aa47.49■■■■■ 5.19
CLDN15-201ENST00000308344 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.36■■■■■ 5.17
CLDN15-201ENST00000308344 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.11■■■■■ 5.13
CLDN15-201ENST00000308344 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
CLDN15-201ENST00000308344 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.78■■■■■ 5.08
CLDN15-201ENST00000308344 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.54■■■■■ 5.04
CLDN15-201ENST00000308344 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.32■■■■■ 5.01
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CLDN15-201ENST00000308344 SCRIBQ14160 1630 aa45.92■■■■■ 4.94
CLDN15-201ENST00000308344 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.89■■■■■ 4.94
CLDN15-201ENST00000308344 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.69■■■■■ 4.9
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CLDN15-201ENST00000308344 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.89■■■■■ 4.78
CLDN15-201ENST00000308344 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.64■■■■■ 4.74
CLDN15-201ENST00000308344 SMARCA4P51532 1647 aa43.92■■■■■ 4.62
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CLDN15-201ENST00000308344 NCAPD3P42695 1498 aa43.84■■■■■ 4.61
CLDN15-201ENST00000308344 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.78■■■■■ 4.6
CLDN15-201ENST00000308344 SMARCA2P51531 1590 aa43.72■■■■■ 4.59
CLDN15-201ENST00000308344 HMGXB3Q12766 1538 aa43.56■■■■■ 4.56
CLDN15-201ENST00000308344 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.55■■■■■ 4.56
CLDN15-201ENST00000308344 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.52■■■■■ 4.56
CLDN15-201ENST00000308344 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
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CLDN15-201ENST00000308344 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
CLDN15-201ENST00000308344 NESP48681 1621 aa42.85■■■■■ 4.45
CLDN15-201ENST00000308344 ERCC6Q03468 1493 aa42.8■■■■■ 4.44
CLDN15-201ENST00000308344 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.73■■■■■ 4.43
CLDN15-201ENST00000308344 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
CLDN15-201ENST00000308344 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.53■■■■■ 4.4
CLDN15-201ENST00000308344 CUX2O14529 1486 aa42.51■■■■■ 4.39
CLDN15-201ENST00000308344 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.45■■■■■ 4.39
CLDN15-201ENST00000308344 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.34■■■■■ 4.37
CLDN15-201ENST00000308344 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
CLDN15-201ENST00000308344 CFTRP13569 1480 aa42.2■■■■■ 4.35
CLDN15-201ENST00000308344 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.08■■■■■ 4.33
CLDN15-201ENST00000308344 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.02■■■■■ 4.32
CLDN15-201ENST00000308344 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.01■■■■■ 4.32
CLDN15-201ENST00000308344 CEP164Q9UPV0 1460 aa42■■■■■ 4.31
CLDN15-201ENST00000308344 WDR62O43379 1518 aa41.89■■■■■ 4.3
CLDN15-201ENST00000308344 PRDM2Q13029 1718 aa41.86■■■■■ 4.29
CLDN15-201ENST00000308344 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.63■■■■■ 4.26
CLDN15-201ENST00000308344 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
CLDN15-201ENST00000308344 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
CLDN15-201ENST00000308344 ABCC8Q09428 1581 aa41.32■■■■■ 4.21
CLDN15-201ENST00000308344 TOPBP1Q92547 1522 aa41.31■■■■■ 4.2
CLDN15-201ENST00000308344 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.23■■■■■ 4.19
CLDN15-201ENST00000308344 IFT140Q96RY7 1462 aa41.14■■■■■ 4.18
CLDN15-201ENST00000308344 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
CLDN15-201ENST00000308344 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
CLDN15-201ENST00000308344 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
CLDN15-201ENST00000308344 CUX1P39880 1505 aa40.86■■■■■ 4.13
CLDN15-201ENST00000308344 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
CLDN15-201ENST00000308344 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.77■■■■■ 4.12
CLDN15-201ENST00000308344 SOGA1O94964 1423 aa40.77■■■■■ 4.12
CLDN15-201ENST00000308344 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.75■■■■■ 4.11
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CLDN15-201ENST00000308344 WDR97A6NE52 1622 aa40.57■■■■■ 4.08
CLDN15-201ENST00000308344 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.49■■■■■ 4.07
CLDN15-201ENST00000308344 TOP2BQ02880 1626 aa40.44■■■■■ 4.07
CLDN15-201ENST00000308344 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.44■■■■■ 4.06
CLDN15-201ENST00000308344 SYNJ1O43426 1573 aa40.38■■■■■ 4.06
CLDN15-201ENST00000308344 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.38■■■■■ 4.06
CLDN15-201ENST00000308344 CHD1O14646 1710 aa40.35■■■■■ 4.05
CLDN15-201ENST00000308344 GRIN2BQ13224 1484 aa40.33■■■■■ 4.05
CLDN15-201ENST00000308344 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.3■■■■■ 4.04
CLDN15-201ENST00000308344 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.29■■■■■ 4.04
CLDN15-201ENST00000308344 FBLN2P98095 1184 aa40.28■■■■■ 4.04
CLDN15-201ENST00000308344 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
CLDN15-201ENST00000308344 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.24■■■■■ 4.03
CLDN15-201ENST00000308344 PBRM1Q86U86 1689 aa40.22■■■■■ 4.03
CLDN15-201ENST00000308344 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
CLDN15-201ENST00000308344 SYNJ2O15056 1496 aa40.12■■■■■ 4.01
CLDN15-201ENST00000308344 TRIM41Q8WV44 630 aa40.06■■■■■ 4
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CLDN15-201ENST00000308344 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.05■■■■■ 4
CLDN15-201ENST00000308344 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.05■■■■■ 4
CLDN15-201ENST00000308344 ARHGEF11O15085 1522 aa40.01■■■■■ 4
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CLDN15-201ENST00000308344 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.89■■■■□ 3.98
CLDN15-201ENST00000308344 ADAMTS12P58397 1594 aa39.87■■■■□ 3.97
CLDN15-201ENST00000308344 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.82■■■■□ 3.96
CLDN15-201ENST00000308344 GRIN2AQ12879 1464 aa39.81■■■■□ 3.96
CLDN15-201ENST00000308344 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.68■■■■□ 3.94
CLDN15-201ENST00000308344 KIF27Q86VH2 1401 aa39.67■■■■□ 3.94
CLDN15-201ENST00000308344 NUP160Q12769 1436 aa39.66■■■■□ 3.94
CLDN15-201ENST00000308344 ARAP1Q96P48 1450 aa39.65■■■■□ 3.94
CLDN15-201ENST00000308344 CEP170Q5SW79 1584 aa39.62■■■■□ 3.93
CLDN15-201ENST00000308344 IGF1RP08069 1367 aa39.57■■■■□ 3.92
CLDN15-201ENST00000308344 CUL7Q14999 1698 aa39.46■■■■□ 3.91
CLDN15-201ENST00000308344 SHROOM2Q13796 1616 aa39.4■■■■□ 3.9
CLDN15-201ENST00000308344 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.32■■■■□ 3.88
CLDN15-201ENST00000308344 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.31■■■■□ 3.88
CLDN15-201ENST00000308344 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.29■■■■□ 3.88
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