Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TP73O15350 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TP73O15350 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TP73O15350 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TP73O15350 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TP73O15350 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TP73O15350 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TP73O15350 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TP73O15350 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TP73O15350 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TP73O15350 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP73O15350 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TP73O15350 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TP73O15350 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TP73O15350 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TP73O15350 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TP73O15350 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TP73O15350 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TP73O15350 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TP73O15350 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP73O15350 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP73O15350 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP73O15350 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP73O15350 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP73O15350 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP73O15350 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TP73O15350 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP73O15350 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP73O15350 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP73O15350 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP73O15350 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP73O15350 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP73O15350 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP73O15350 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP73O15350 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP73O15350 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP73O15350 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP73O15350 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP73O15350 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP73O15350 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP73O15350 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP73O15350 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP73O15350 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP73O15350 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP73O15350 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP73O15350 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP73O15350 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP73O15350 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP73O15350 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP73O15350 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP73O15350 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP73O15350 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP73O15350 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP73O15350 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP73O15350 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP73O15350 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP73O15350 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP73O15350 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP73O15350 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP73O15350 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP73O15350 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP73O15350 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TP73O15350 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TP73O15350 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TP73O15350 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TP73O15350 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TP73O15350 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TP73O15350 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TP73O15350 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP73O15350 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP73O15350 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP73O15350 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP73O15350 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TP73O15350 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP73O15350 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TP73O15350 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP73O15350 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP73O15350 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP73O15350 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP73O15350 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP73O15350 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP73O15350 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP73O15350 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP73O15350 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TP73O15350 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TP73O15350 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms