RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559651.1

ANKRD9-204, Transcript of ankyrin repeat domain 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD9, Length 1,444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD9-204ENST00000559651 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.38■■■■■ 6.78
ANKRD9-204ENST00000559651 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.71■■■■■ 5.71
ANKRD9-204ENST00000559651 ABCC9O60706 1549 aa49.59■■■■■ 5.53
ANKRD9-204ENST00000559651 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.14■■■■■ 5.3
ANKRD9-204ENST00000559651 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.81■■■■■ 5.24
ANKRD9-204ENST00000559651 NACADO15069 1562 aa47.76■■■■■ 5.24
ANKRD9-204ENST00000559651 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.74■■■■■ 5.23
ANKRD9-204ENST00000559651 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.56■■■■■ 5.2
ANKRD9-204ENST00000559651 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.46■■■■■ 5.19
ANKRD9-204ENST00000559651 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.53■■■■■ 5.04
ANKRD9-204ENST00000559651 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.41■■■■■ 5.02
ANKRD9-204ENST00000559651 SCRIBQ14160 1630 aa46.4■■■■■ 5.02
ANKRD9-204ENST00000559651 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.22■■■■■ 4.99
ANKRD9-204ENST00000559651 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.81■■■■■ 4.92
ANKRD9-204ENST00000559651 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.35■■■■■ 4.85
ANKRD9-204ENST00000559651 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
ANKRD9-204ENST00000559651 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.77■■■■■ 4.76
ANKRD9-204ENST00000559651 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.71■■■■■ 4.75
ANKRD9-204ENST00000559651 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.71
ANKRD9-204ENST00000559651 SMARCA4P51532 1647 aa44.39■■■■■ 4.7
ANKRD9-204ENST00000559651 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.23■■■■■ 4.67
ANKRD9-204ENST00000559651 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.19■■■■■ 4.67
ANKRD9-204ENST00000559651 NCAPD3P42695 1498 aa44.15■■■■■ 4.66
ANKRD9-204ENST00000559651 SMARCA2P51531 1590 aa44.11■■■■■ 4.65
ANKRD9-204ENST00000559651 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.94■■■■■ 4.63
ANKRD9-204ENST00000559651 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
ANKRD9-204ENST00000559651 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
ANKRD9-204ENST00000559651 HMGXB3Q12766 1538 aa43.84■■■■■ 4.61
ANKRD9-204ENST00000559651 WIZO95785 1651 aa43.69■■■■■ 4.58
ANKRD9-204ENST00000559651 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
ANKRD9-204ENST00000559651 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
ANKRD9-204ENST00000559651 NESP48681 1621 aa42.96■■■■■ 4.47
ANKRD9-204ENST00000559651 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.94■■■■■ 4.46
ANKRD9-204ENST00000559651 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.86■■■■■ 4.45
ANKRD9-204ENST00000559651 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.84■■■■■ 4.45
ANKRD9-204ENST00000559651 ERCC6Q03468 1493 aa42.75■■■■■ 4.43
ANKRD9-204ENST00000559651 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.69■■■■■ 4.43
ANKRD9-204ENST00000559651 CFTRP13569 1480 aa42.66■■■■■ 4.42
ANKRD9-204ENST00000559651 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.38■■■■■ 4.37
ANKRD9-204ENST00000559651 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.28■■■■■ 4.36
ANKRD9-204ENST00000559651 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.28■■■■■ 4.36
ANKRD9-204ENST00000559651 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.16■■■■■ 4.34
ANKRD9-204ENST00000559651 CUX2O14529 1486 aa42.14■■■■■ 4.34
ANKRD9-204ENST00000559651 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
ANKRD9-204ENST00000559651 PRDM2Q13029 1718 aa42.05■■■■■ 4.32
ANKRD9-204ENST00000559651 WDR62O43379 1518 aa41.93■■■■■ 4.3
ANKRD9-204ENST00000559651 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.3
ANKRD9-204ENST00000559651 ABCC8Q09428 1581 aa41.76■■■■■ 4.28
ANKRD9-204ENST00000559651 TOPBP1Q92547 1522 aa41.69■■■■■ 4.26
ANKRD9-204ENST00000559651 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.62■■■■■ 4.25
ANKRD9-204ENST00000559651 CUX1P39880 1505 aa41.46■■■■■ 4.23
ANKRD9-204ENST00000559651 IFT140Q96RY7 1462 aa41.4■■■■■ 4.22
ANKRD9-204ENST00000559651 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.39■■■■■ 4.22
ANKRD9-204ENST00000559651 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
ANKRD9-204ENST00000559651 SOGA1O94964 1423 aa41.31■■■■■ 4.2
ANKRD9-204ENST00000559651 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.31■■■■■ 4.2
ANKRD9-204ENST00000559651 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.22■■■■■ 4.19
ANKRD9-204ENST00000559651 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
ANKRD9-204ENST00000559651 TOP2BQ02880 1626 aa41.14■■■■■ 4.18
ANKRD9-204ENST00000559651 SYNJ1O43426 1573 aa41.13■■■■■ 4.18
ANKRD9-204ENST00000559651 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
ANKRD9-204ENST00000559651 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.06■■■■■ 4.16
ANKRD9-204ENST00000559651 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
ANKRD9-204ENST00000559651 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.04■■■■■ 4.161e-15■■■■■ 34.3
ANKRD9-204ENST00000559651 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.92■■■■■ 4.14
ANKRD9-204ENST00000559651 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
ANKRD9-204ENST00000559651 WDR97A6NE52 1622 aa40.82■■■■■ 4.12
ANKRD9-204ENST00000559651 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.77■■■■■ 4.12
ANKRD9-204ENST00000559651 TRIM41Q8WV44 630 aa40.76■■■■■ 4.12
ANKRD9-204ENST00000559651 GRIN2BQ13224 1484 aa40.73■■■■■ 4.11
ANKRD9-204ENST00000559651 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.67■■■■■ 4.1
ANKRD9-204ENST00000559651 OSCARQ8IYS5 282 aa40.65■■■■■ 4.1
ANKRD9-204ENST00000559651 FBLN2P98095 1184 aa40.64■■■■■ 4.1
ANKRD9-204ENST00000559651 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.61■■■■■ 4.09
ANKRD9-204ENST00000559651 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.6■■■■■ 4.09
ANKRD9-204ENST00000559651 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
ANKRD9-204ENST00000559651 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
ANKRD9-204ENST00000559651 KIF27Q86VH2 1401 aa40.53■■■■■ 4.08
ANKRD9-204ENST00000559651 PBRM1Q86U86 1689 aa40.44■■■■■ 4.06
ANKRD9-204ENST00000559651 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.42■■■■■ 4.06
ANKRD9-204ENST00000559651 SYNJ2O15056 1496 aa40.41■■■■■ 4.06
ANKRD9-204ENST00000559651 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.41■■■■■ 4.06
ANKRD9-204ENST00000559651 IGF1RP08069 1367 aa40.36■■■■■ 4.05
ANKRD9-204ENST00000559651 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.33■■■■■ 4.05
ANKRD9-204ENST00000559651 CHD1O14646 1710 aa40.26■■■■■ 4.04
ANKRD9-204ENST00000559651 ADAMTS12P58397 1594 aa40.23■■■■■ 4.03
ANKRD9-204ENST00000559651 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.19■■■■■ 4.02
ANKRD9-204ENST00000559651 GRIN2AQ12879 1464 aa40.17■■■■■ 4.02
ANKRD9-204ENST00000559651 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.14■■■■■ 4.02
ANKRD9-204ENST00000559651 CUL7Q14999 1698 aa40.03■■■■■ 4
ANKRD9-204ENST00000559651 NUP160Q12769 1436 aa39.99■■■■□ 3.99
ANKRD9-204ENST00000559651 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.96■■■■□ 3.99
ANKRD9-204ENST00000559651 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.92■■■■□ 3.98
ANKRD9-204ENST00000559651 EEA1Q15075 1411 aa39.92■■■■□ 3.98
ANKRD9-204ENST00000559651 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
ANKRD9-204ENST00000559651 CEP170Q5SW79 1584 aa39.88■■■■□ 3.97
ANKRD9-204ENST00000559651 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.87■■■■□ 3.97
ANKRD9-204ENST00000559651 ARHGEF11O15085 1522 aa39.77■■■■□ 3.96
ANKRD9-204ENST00000559651 PRXQ9BXM0 1461 aa39.76■■■■□ 3.96
ANKRD9-204ENST00000559651 JPH4Q96JJ6 628 aa39.75■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms