RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623970.1

ARRDC1-AS1-203, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 2,210 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.29■■■■■ 5.32
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.6■■■■■ 4.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.22■■■■■ 4.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.85■■■■□ 3.97
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.77■■■■□ 3.96
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.01■■■■□ 3.84
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ABCC9O60706 1549 aa38.69■■■■□ 3.78
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NACADO15069 1562 aa38.56■■■■□ 3.76
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SCRIBQ14160 1630 aa38.53■■■■□ 3.76
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.03■■■■□ 3.68
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.89■■■■□ 3.66
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.52■■■■□ 3.6
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.39■■■■□ 3.58
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.38■■■■□ 3.57
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 WIZO95785 1651 aa37.16■■■■□ 3.54
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SMARCA4P51532 1647 aa36.94■■■■□ 3.5
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.92■■■■□ 3.5
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.73■■■■□ 3.47
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TRIM41Q8WV44 630 aa36.68■■■■□ 3.46
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.55■■■■□ 3.44
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SMARCA2P51531 1590 aa36.43■■■■□ 3.42
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.42■■■■□ 3.42
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.39■■■■□ 3.42
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.11■■■■□ 3.37
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ABCC8Q09428 1581 aa35.99■■■■□ 3.35
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.85■■■■□ 3.33
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.64■■■■□ 3.3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 HMGXB3Q12766 1538 aa35.62■■■■□ 3.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NCAPD3P42695 1498 aa35.6■■■■□ 3.29
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.6■■■■□ 3.291e-6■■■■■ 58.5
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 HRCP23327 699 aa35.52■■■■□ 3.28
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 EEA1Q15075 1411 aa35.52■■■■□ 3.28
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SOGA1O94964 1423 aa35.51■■■■□ 3.27
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SYNJ1O43426 1573 aa35.43■■■■□ 3.26
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.33■■■■□ 3.25
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.32■■■■□ 3.24
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.18■■■■□ 3.22
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TOP2BQ02880 1626 aa35.18■■■■□ 3.22
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 GOLGA3Q08378 1498 aa35.11■■■■□ 3.21
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.11■■■■□ 3.21
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CEP162Q5TB80 1403 aa35.1■■■■□ 3.21
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CFTRP13569 1480 aa35.09■■■■□ 3.21
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 KIF21BO75037 1637 aa35.02■■■■□ 3.2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.01■■■■□ 3.2
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.99■■■■□ 3.19
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PRDM2Q13029 1718 aa34.94■■■■□ 3.18
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CUX1P39880 1505 aa34.89■■■■□ 3.18
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.79■■■■□ 3.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.72■■■■□ 3.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.61■■■■□ 3.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CLIP1P30622 1438 aa34.61■■■■□ 3.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 KIF27Q86VH2 1401 aa34.6■■■■□ 3.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PRXQ9BXM0 1461 aa34.59■■■■□ 3.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.44■■■■□ 3.1
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.42■■■■□ 3.1
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.37■■■■□ 3.09
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CUX2O14529 1486 aa34.34■■■■□ 3.09
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NESP48681 1621 aa34.26■■■■□ 3.08
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.26■■■■□ 3.07
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.24■■■■□ 3.07
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 IGF1RP08069 1367 aa34.22■■■■□ 3.07
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TOPBP1Q92547 1522 aa34.15■■■■□ 3.06
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 APLP2Q06481 763 aa34.15■■■■□ 3.06
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ARAP1Q96P48 1450 aa34.15■■■■□ 3.06
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.05
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.07■■■■□ 3.04
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.05■■■■□ 3.04
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.01■■■■□ 3.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.98■■■■□ 3.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.98■■■■□ 3.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.94■■■■□ 3.02
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 WDR97A6NE52 1622 aa33.85■■■■□ 3.01
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CUL7Q14999 1698 aa33.83■■■■□ 3.01
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.82■■■■□ 3
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.7■■■□□ 2.99
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.62■■■□□ 2.97
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.61■■■□□ 2.97
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MAP3K1Q13233 1512 aa33.61■■■□□ 2.97
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.57■■■□□ 2.96
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms