Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COA4Q9NYJ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COA4Q9NYJ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms