Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPNS2Q96L46 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPNS2Q96L46 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAPNS2Q96L46 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms