Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
LRRC59Q96AG4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRC59Q96AG4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
LRRC59Q96AG4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LRRC59Q96AG4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms