Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGAP27Q6ZUM4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ARHGAP27Q6ZUM4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms