Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPTAN1Q13813 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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