RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370126.1

RTCA-202, Transcript of RNA 3'-terminal phosphate cyclase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTCA, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTCA-202ENST00000370126 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.79■■■■■ 6.2
RTCA-202ENST00000370126 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.18■■■■■ 5.3
RTCA-202ENST00000370126 ABCC9O60706 1549 aa47.77■■■■■ 5.24
RTCA-202ENST00000370126 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.66■■■■■ 4.9
RTCA-202ENST00000370126 NACADO15069 1562 aa45.44■■■■■ 4.86
RTCA-202ENST00000370126 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.13■■■■■ 4.82
RTCA-202ENST00000370126 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.94■■■■■ 4.78
RTCA-202ENST00000370126 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.68■■■■■ 4.74
RTCA-202ENST00000370126 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
RTCA-202ENST00000370126 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.49■■■■■ 4.71
RTCA-202ENST00000370126 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.49■■■■■ 4.71
RTCA-202ENST00000370126 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.48■■■■■ 4.71
RTCA-202ENST00000370126 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.34■■■■■ 4.69
RTCA-202ENST00000370126 SCRIBQ14160 1630 aa43.88■■■■■ 4.62
RTCA-202ENST00000370126 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.79■■■■■ 4.6
RTCA-202ENST00000370126 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
RTCA-202ENST00000370126 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.21■■■■■ 4.51
RTCA-202ENST00000370126 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.01■■■■■ 4.48
RTCA-202ENST00000370126 NCAPD3P42695 1498 aa41.92■■■■■ 4.3
RTCA-202ENST00000370126 SMARCA4P51532 1647 aa41.91■■■■■ 4.3
RTCA-202ENST00000370126 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.85■■■■■ 4.29
RTCA-202ENST00000370126 SMARCA2P51531 1590 aa41.76■■■■■ 4.28
RTCA-202ENST00000370126 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
RTCA-202ENST00000370126 HMGXB3Q12766 1538 aa41.68■■■■■ 4.26
RTCA-202ENST00000370126 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.51■■■■■ 4.24
RTCA-202ENST00000370126 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
RTCA-202ENST00000370126 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.45■■■■■ 4.23
RTCA-202ENST00000370126 ERCC6Q03468 1493 aa41.22■■■■■ 4.19
RTCA-202ENST00000370126 NESP48681 1621 aa41.15■■■■■ 4.18
RTCA-202ENST00000370126 CUX2O14529 1486 aa41.07■■■■■ 4.16
RTCA-202ENST00000370126 WIZO95785 1651 aa40.98■■■■■ 4.15
RTCA-202ENST00000370126 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.95■■■■■ 4.15
RTCA-202ENST00000370126 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
RTCA-202ENST00000370126 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
RTCA-202ENST00000370126 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.67■■■■■ 4.1
RTCA-202ENST00000370126 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.67■■■■■ 4.1
RTCA-202ENST00000370126 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.64■■■■■ 4.1
RTCA-202ENST00000370126 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.61■■■■■ 4.09
RTCA-202ENST00000370126 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
RTCA-202ENST00000370126 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.32■■■■■ 4.04
RTCA-202ENST00000370126 CFTRP13569 1480 aa40.27■■■■■ 4.04
RTCA-202ENST00000370126 WDR62O43379 1518 aa40.23■■■■■ 4.03
RTCA-202ENST00000370126 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.22■■■■■ 4.03
RTCA-202ENST00000370126 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.19■■■■■ 4.03
RTCA-202ENST00000370126 CCDC88BA6NC98 1476 aa40■■■■□ 3.99
RTCA-202ENST00000370126 PRDM2Q13029 1718 aa39.97■■■■□ 3.99
RTCA-202ENST00000370126 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
RTCA-202ENST00000370126 TOPBP1Q92547 1522 aa39.48■■■■□ 3.91
RTCA-202ENST00000370126 ABCC8Q09428 1581 aa39.42■■■■□ 3.9
RTCA-202ENST00000370126 IFT140Q96RY7 1462 aa39.4■■■■□ 3.9
RTCA-202ENST00000370126 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.39■■■■□ 3.9
RTCA-202ENST00000370126 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
RTCA-202ENST00000370126 OSCARQ8IYS5 282 aa39.18■■■■□ 3.86
RTCA-202ENST00000370126 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
RTCA-202ENST00000370126 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
RTCA-202ENST00000370126 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
RTCA-202ENST00000370126 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
RTCA-202ENST00000370126 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.96■■■■□ 3.832e-11■■■■■ 27.9
RTCA-202ENST00000370126 TRIM41Q8WV44 630 aa38.94■■■■□ 3.82
RTCA-202ENST00000370126 CUX1P39880 1505 aa38.94■■■■□ 3.82
RTCA-202ENST00000370126 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.93■■■■□ 3.82
RTCA-202ENST00000370126 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.9■■■■□ 3.82
RTCA-202ENST00000370126 SOGA1O94964 1423 aa38.89■■■■□ 3.82
RTCA-202ENST00000370126 CHD1O14646 1710 aa38.79■■■■□ 3.8
RTCA-202ENST00000370126 WDR97A6NE52 1622 aa38.78■■■■□ 3.8
RTCA-202ENST00000370126 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
RTCA-202ENST00000370126 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.71■■■■□ 3.79
RTCA-202ENST00000370126 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.71■■■■□ 3.79
RTCA-202ENST00000370126 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.71■■■■□ 3.79
RTCA-202ENST00000370126 ARHGEF11O15085 1522 aa38.62■■■■□ 3.77
RTCA-202ENST00000370126 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.6■■■■□ 3.77
RTCA-202ENST00000370126 FBLN2P98095 1184 aa38.59■■■■□ 3.77
RTCA-202ENST00000370126 GRIN2BQ13224 1484 aa38.54■■■■□ 3.76
RTCA-202ENST00000370126 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
RTCA-202ENST00000370126 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.49■■■■□ 3.75
RTCA-202ENST00000370126 PBRM1Q86U86 1689 aa38.47■■■■□ 3.75
RTCA-202ENST00000370126 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.45■■■■□ 3.75
RTCA-202ENST00000370126 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.43■■■■□ 3.74
RTCA-202ENST00000370126 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.43■■■■□ 3.74
RTCA-202ENST00000370126 TOP2BQ02880 1626 aa38.41■■■■□ 3.74
RTCA-202ENST00000370126 SYNJ2O15056 1496 aa38.39■■■■□ 3.74
RTCA-202ENST00000370126 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.38■■■■□ 3.74
RTCA-202ENST00000370126 SYNJ1O43426 1573 aa38.37■■■■□ 3.73
RTCA-202ENST00000370126 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
RTCA-202ENST00000370126 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.35■■■■□ 3.73
RTCA-202ENST00000370126 ARAP1Q96P48 1450 aa38.26■■■■□ 3.72
RTCA-202ENST00000370126 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.23■■■■□ 3.71
RTCA-202ENST00000370126 ADAMTS12P58397 1594 aa38.12■■■■□ 3.69
RTCA-202ENST00000370126 GRIN2AQ12879 1464 aa38.06■■■■□ 3.68
RTCA-202ENST00000370126 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.02■■■■□ 3.68
RTCA-202ENST00000370126 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.97■■■■□ 3.67
RTCA-202ENST00000370126 NUP160Q12769 1436 aa37.93■■■■□ 3.66
RTCA-202ENST00000370126 CEP170Q5SW79 1584 aa37.93■■■■□ 3.66
RTCA-202ENST00000370126 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.76■■■■□ 3.63
RTCA-202ENST00000370126 SHROOM2Q13796 1616 aa37.75■■■■□ 3.63
RTCA-202ENST00000370126 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
RTCA-202ENST00000370126 KIF27Q86VH2 1401 aa37.63■■■■□ 3.61
RTCA-202ENST00000370126 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.57■■■■□ 3.61
RTCA-202ENST00000370126 IGF1RP08069 1367 aa37.56■■■■□ 3.6
RTCA-202ENST00000370126 CUL7Q14999 1698 aa37.55■■■■□ 3.6
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