Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM4SF4P48230 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TM4SF4P48230 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms