Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD10P28358 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD10P28358 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD10P28358 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms