Protein–RNA interactions for Protein: S4R325

URGCP-MRPS24, URGCP-MRPS24 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URGCP-MRPS24S4R325 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
URGCP-MRPS24S4R325 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
URGCP-MRPS24S4R325 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
URGCP-MRPS24S4R325 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
URGCP-MRPS24S4R325 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
URGCP-MRPS24S4R325 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
URGCP-MRPS24S4R325 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
URGCP-MRPS24S4R325 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
URGCP-MRPS24S4R325 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
URGCP-MRPS24S4R325 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
URGCP-MRPS24S4R325 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
URGCP-MRPS24S4R325 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
URGCP-MRPS24S4R325 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
URGCP-MRPS24S4R325 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
URGCP-MRPS24S4R325 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
URGCP-MRPS24S4R325 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
URGCP-MRPS24S4R325 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
URGCP-MRPS24S4R325 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
URGCP-MRPS24S4R325 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
URGCP-MRPS24S4R325 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
URGCP-MRPS24S4R325 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
URGCP-MRPS24S4R325 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
URGCP-MRPS24S4R325 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
URGCP-MRPS24S4R325 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
URGCP-MRPS24S4R325 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
URGCP-MRPS24S4R325 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
URGCP-MRPS24S4R325 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
URGCP-MRPS24S4R325 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
URGCP-MRPS24S4R325 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
URGCP-MRPS24S4R325 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
URGCP-MRPS24S4R325 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
URGCP-MRPS24S4R325 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
URGCP-MRPS24S4R325 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
URGCP-MRPS24S4R325 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
URGCP-MRPS24S4R325 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
URGCP-MRPS24S4R325 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
URGCP-MRPS24S4R325 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
URGCP-MRPS24S4R325 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
URGCP-MRPS24S4R325 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
URGCP-MRPS24S4R325 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
URGCP-MRPS24S4R325 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
URGCP-MRPS24S4R325 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
URGCP-MRPS24S4R325 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
URGCP-MRPS24S4R325 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
URGCP-MRPS24S4R325 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
URGCP-MRPS24S4R325 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
URGCP-MRPS24S4R325 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
URGCP-MRPS24S4R325 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
URGCP-MRPS24S4R325 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
URGCP-MRPS24S4R325 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
URGCP-MRPS24S4R325 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
URGCP-MRPS24S4R325 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
URGCP-MRPS24S4R325 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
URGCP-MRPS24S4R325 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
URGCP-MRPS24S4R325 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
URGCP-MRPS24S4R325 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
URGCP-MRPS24S4R325 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
URGCP-MRPS24S4R325 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
URGCP-MRPS24S4R325 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
URGCP-MRPS24S4R325 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
URGCP-MRPS24S4R325 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
URGCP-MRPS24S4R325 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
URGCP-MRPS24S4R325 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
URGCP-MRPS24S4R325 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
URGCP-MRPS24S4R325 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
URGCP-MRPS24S4R325 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
URGCP-MRPS24S4R325 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
URGCP-MRPS24S4R325 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
URGCP-MRPS24S4R325 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
URGCP-MRPS24S4R325 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
URGCP-MRPS24S4R325 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
URGCP-MRPS24S4R325 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
URGCP-MRPS24S4R325 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
URGCP-MRPS24S4R325 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
URGCP-MRPS24S4R325 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
URGCP-MRPS24S4R325 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
URGCP-MRPS24S4R325 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
URGCP-MRPS24S4R325 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
URGCP-MRPS24S4R325 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
URGCP-MRPS24S4R325 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
URGCP-MRPS24S4R325 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
URGCP-MRPS24S4R325 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
URGCP-MRPS24S4R325 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
URGCP-MRPS24S4R325 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
URGCP-MRPS24S4R325 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
URGCP-MRPS24S4R325 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
URGCP-MRPS24S4R325 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
URGCP-MRPS24S4R325 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
URGCP-MRPS24S4R325 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
URGCP-MRPS24S4R325 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
URGCP-MRPS24S4R325 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
URGCP-MRPS24S4R325 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
URGCP-MRPS24S4R325 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
URGCP-MRPS24S4R325 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
URGCP-MRPS24S4R325 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
URGCP-MRPS24S4R325 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
URGCP-MRPS24S4R325 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
URGCP-MRPS24S4R325 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
URGCP-MRPS24S4R325 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
URGCP-MRPS24S4R325 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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