Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E6

PCDHB3, Protocadherin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB3Q9Y5E6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB3Q9Y5E6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB3Q9Y5E6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB3Q9Y5E6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB3Q9Y5E6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB3Q9Y5E6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB3Q9Y5E6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB3Q9Y5E6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB3Q9Y5E6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB3Q9Y5E6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB3Q9Y5E6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB3Q9Y5E6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB3Q9Y5E6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB3Q9Y5E6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB3Q9Y5E6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB3Q9Y5E6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHB3Q9Y5E6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB3Q9Y5E6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB3Q9Y5E6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB3Q9Y5E6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB3Q9Y5E6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB3Q9Y5E6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB3Q9Y5E6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB3Q9Y5E6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB3Q9Y5E6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB3Q9Y5E6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB3Q9Y5E6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB3Q9Y5E6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB3Q9Y5E6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB3Q9Y5E6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB3Q9Y5E6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB3Q9Y5E6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB3Q9Y5E6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB3Q9Y5E6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB3Q9Y5E6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB3Q9Y5E6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB3Q9Y5E6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB3Q9Y5E6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB3Q9Y5E6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB3Q9Y5E6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB3Q9Y5E6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB3Q9Y5E6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB3Q9Y5E6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB3Q9Y5E6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB3Q9Y5E6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB3Q9Y5E6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB3Q9Y5E6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB3Q9Y5E6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB3Q9Y5E6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB3Q9Y5E6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB3Q9Y5E6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB3Q9Y5E6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB3Q9Y5E6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB3Q9Y5E6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB3Q9Y5E6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB3Q9Y5E6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB3Q9Y5E6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB3Q9Y5E6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB3Q9Y5E6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB3Q9Y5E6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB3Q9Y5E6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB3Q9Y5E6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB3Q9Y5E6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB3Q9Y5E6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB3Q9Y5E6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB3Q9Y5E6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB3Q9Y5E6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB3Q9Y5E6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB3Q9Y5E6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB3Q9Y5E6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB3Q9Y5E6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB3Q9Y5E6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB3Q9Y5E6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB3Q9Y5E6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB3Q9Y5E6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB3Q9Y5E6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB3Q9Y5E6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB3Q9Y5E6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB3Q9Y5E6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB3Q9Y5E6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB3Q9Y5E6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB3Q9Y5E6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB3Q9Y5E6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB3Q9Y5E6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB3Q9Y5E6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB3Q9Y5E6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB3Q9Y5E6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB3Q9Y5E6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB3Q9Y5E6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB3Q9Y5E6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB3Q9Y5E6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB3Q9Y5E6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB3Q9Y5E6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB3Q9Y5E6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB3Q9Y5E6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB3Q9Y5E6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB3Q9Y5E6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB3Q9Y5E6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB3Q9Y5E6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB3Q9Y5E6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms