Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAB39Q9Y376 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAB39Q9Y376 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAB39Q9Y376 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAB39Q9Y376 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAB39Q9Y376 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAB39Q9Y376 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAB39Q9Y376 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAB39Q9Y376 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAB39Q9Y376 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAB39Q9Y376 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAB39Q9Y376 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAB39Q9Y376 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAB39Q9Y376 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAB39Q9Y376 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAB39Q9Y376 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAB39Q9Y376 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAB39Q9Y376 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAB39Q9Y376 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAB39Q9Y376 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAB39Q9Y376 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAB39Q9Y376 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAB39Q9Y376 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAB39Q9Y376 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAB39Q9Y376 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CAB39Q9Y376 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAB39Q9Y376 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAB39Q9Y376 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAB39Q9Y376 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAB39Q9Y376 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAB39Q9Y376 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAB39Q9Y376 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAB39Q9Y376 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAB39Q9Y376 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAB39Q9Y376 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAB39Q9Y376 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAB39Q9Y376 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAB39Q9Y376 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAB39Q9Y376 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAB39Q9Y376 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAB39Q9Y376 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAB39Q9Y376 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAB39Q9Y376 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAB39Q9Y376 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAB39Q9Y376 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAB39Q9Y376 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAB39Q9Y376 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAB39Q9Y376 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAB39Q9Y376 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAB39Q9Y376 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAB39Q9Y376 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAB39Q9Y376 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAB39Q9Y376 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAB39Q9Y376 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAB39Q9Y376 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAB39Q9Y376 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAB39Q9Y376 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAB39Q9Y376 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAB39Q9Y376 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAB39Q9Y376 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAB39Q9Y376 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAB39Q9Y376 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAB39Q9Y376 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAB39Q9Y376 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAB39Q9Y376 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAB39Q9Y376 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAB39Q9Y376 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAB39Q9Y376 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAB39Q9Y376 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAB39Q9Y376 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAB39Q9Y376 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAB39Q9Y376 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAB39Q9Y376 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAB39Q9Y376 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAB39Q9Y376 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAB39Q9Y376 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAB39Q9Y376 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAB39Q9Y376 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAB39Q9Y376 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAB39Q9Y376 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAB39Q9Y376 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAB39Q9Y376 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAB39Q9Y376 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAB39Q9Y376 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAB39Q9Y376 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAB39Q9Y376 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAB39Q9Y376 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAB39Q9Y376 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms