Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y255

PRELID1, PRELI domain-containing protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID1Q9Y255 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRELID1Q9Y255 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRELID1Q9Y255 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRELID1Q9Y255 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRELID1Q9Y255 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRELID1Q9Y255 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRELID1Q9Y255 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID1Q9Y255 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRELID1Q9Y255 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRELID1Q9Y255 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRELID1Q9Y255 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRELID1Q9Y255 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRELID1Q9Y255 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRELID1Q9Y255 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRELID1Q9Y255 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRELID1Q9Y255 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRELID1Q9Y255 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRELID1Q9Y255 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRELID1Q9Y255 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRELID1Q9Y255 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRELID1Q9Y255 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRELID1Q9Y255 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRELID1Q9Y255 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRELID1Q9Y255 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRELID1Q9Y255 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRELID1Q9Y255 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRELID1Q9Y255 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRELID1Q9Y255 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRELID1Q9Y255 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRELID1Q9Y255 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRELID1Q9Y255 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRELID1Q9Y255 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRELID1Q9Y255 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRELID1Q9Y255 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRELID1Q9Y255 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRELID1Q9Y255 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRELID1Q9Y255 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRELID1Q9Y255 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRELID1Q9Y255 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRELID1Q9Y255 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRELID1Q9Y255 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRELID1Q9Y255 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRELID1Q9Y255 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRELID1Q9Y255 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRELID1Q9Y255 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRELID1Q9Y255 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRELID1Q9Y255 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRELID1Q9Y255 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRELID1Q9Y255 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRELID1Q9Y255 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRELID1Q9Y255 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRELID1Q9Y255 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRELID1Q9Y255 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRELID1Q9Y255 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRELID1Q9Y255 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRELID1Q9Y255 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRELID1Q9Y255 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRELID1Q9Y255 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRELID1Q9Y255 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRELID1Q9Y255 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRELID1Q9Y255 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRELID1Q9Y255 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRELID1Q9Y255 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRELID1Q9Y255 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRELID1Q9Y255 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRELID1Q9Y255 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRELID1Q9Y255 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRELID1Q9Y255 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRELID1Q9Y255 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRELID1Q9Y255 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRELID1Q9Y255 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRELID1Q9Y255 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRELID1Q9Y255 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRELID1Q9Y255 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRELID1Q9Y255 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRELID1Q9Y255 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRELID1Q9Y255 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRELID1Q9Y255 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRELID1Q9Y255 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRELID1Q9Y255 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRELID1Q9Y255 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRELID1Q9Y255 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRELID1Q9Y255 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRELID1Q9Y255 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRELID1Q9Y255 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRELID1Q9Y255 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRELID1Q9Y255 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRELID1Q9Y255 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms