Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TNNQ9UQP3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TNNQ9UQP3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TNNQ9UQP3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TNNQ9UQP3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
TNNQ9UQP3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TNNQ9UQP3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNNQ9UQP3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNNQ9UQP3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNNQ9UQP3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TNNQ9UQP3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TNNQ9UQP3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TNNQ9UQP3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TNNQ9UQP3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TNNQ9UQP3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TNNQ9UQP3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNNQ9UQP3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TNNQ9UQP3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TNNQ9UQP3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNNQ9UQP3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TNNQ9UQP3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TNNQ9UQP3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TNNQ9UQP3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNNQ9UQP3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TNNQ9UQP3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TNNQ9UQP3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNNQ9UQP3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TNNQ9UQP3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TNNQ9UQP3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNNQ9UQP3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNNQ9UQP3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNNQ9UQP3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TNNQ9UQP3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TNNQ9UQP3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
TNNQ9UQP3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNNQ9UQP3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNNQ9UQP3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNNQ9UQP3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TNNQ9UQP3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TNNQ9UQP3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
TNNQ9UQP3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNNQ9UQP3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TNNQ9UQP3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNNQ9UQP3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNNQ9UQP3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNNQ9UQP3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNNQ9UQP3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNNQ9UQP3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNNQ9UQP3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TNNQ9UQP3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TNNQ9UQP3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
TNNQ9UQP3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNNQ9UQP3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNNQ9UQP3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TNNQ9UQP3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNNQ9UQP3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNNQ9UQP3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNNQ9UQP3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNNQ9UQP3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNNQ9UQP3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TNNQ9UQP3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
TNNQ9UQP3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNNQ9UQP3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNNQ9UQP3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TNNQ9UQP3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNNQ9UQP3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNNQ9UQP3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNNQ9UQP3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNNQ9UQP3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNNQ9UQP3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNNQ9UQP3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNNQ9UQP3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
TNNQ9UQP3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNNQ9UQP3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TNNQ9UQP3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TNNQ9UQP3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TNNQ9UQP3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNNQ9UQP3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNNQ9UQP3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNNQ9UQP3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNNQ9UQP3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNNQ9UQP3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNNQ9UQP3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNNQ9UQP3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNNQ9UQP3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNNQ9UQP3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNNQ9UQP3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNNQ9UQP3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNNQ9UQP3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNNQ9UQP3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNNQ9UQP3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNNQ9UQP3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TNNQ9UQP3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNNQ9UQP3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNNQ9UQP3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNNQ9UQP3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TNNQ9UQP3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TNNQ9UQP3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TNNQ9UQP3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNNQ9UQP3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms