Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLXNB3Q9ULL4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLXNB3Q9ULL4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLXNB3Q9ULL4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLXNB3Q9ULL4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNB3Q9ULL4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNB3Q9ULL4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNB3Q9ULL4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNB3Q9ULL4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNB3Q9ULL4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNB3Q9ULL4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNB3Q9ULL4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNB3Q9ULL4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNB3Q9ULL4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNB3Q9ULL4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNB3Q9ULL4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNB3Q9ULL4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNB3Q9ULL4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNB3Q9ULL4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNB3Q9ULL4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNB3Q9ULL4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNB3Q9ULL4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNB3Q9ULL4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNB3Q9ULL4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNB3Q9ULL4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNB3Q9ULL4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNB3Q9ULL4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNB3Q9ULL4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNB3Q9ULL4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLXNB3Q9ULL4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLXNB3Q9ULL4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNB3Q9ULL4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNB3Q9ULL4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNB3Q9ULL4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLXNB3Q9ULL4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLXNB3Q9ULL4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNB3Q9ULL4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNB3Q9ULL4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNB3Q9ULL4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLXNB3Q9ULL4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLXNB3Q9ULL4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNB3Q9ULL4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLXNB3Q9ULL4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLXNB3Q9ULL4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNB3Q9ULL4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNB3Q9ULL4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNB3Q9ULL4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNB3Q9ULL4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNB3Q9ULL4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNB3Q9ULL4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNB3Q9ULL4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNB3Q9ULL4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PLXNB3Q9ULL4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNB3Q9ULL4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNB3Q9ULL4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PLXNB3Q9ULL4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLXNB3Q9ULL4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLXNB3Q9ULL4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLXNB3Q9ULL4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PLXNB3Q9ULL4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLXNB3Q9ULL4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLXNB3Q9ULL4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PLXNB3Q9ULL4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNB3Q9ULL4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLXNB3Q9ULL4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNB3Q9ULL4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNB3Q9ULL4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PLXNB3Q9ULL4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNB3Q9ULL4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNB3Q9ULL4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNB3Q9ULL4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNB3Q9ULL4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNB3Q9ULL4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNB3Q9ULL4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNB3Q9ULL4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNB3Q9ULL4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNB3Q9ULL4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXNB3Q9ULL4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXNB3Q9ULL4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXNB3Q9ULL4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXNB3Q9ULL4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXNB3Q9ULL4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNB3Q9ULL4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLXNB3Q9ULL4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLXNB3Q9ULL4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLXNB3Q9ULL4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNB3Q9ULL4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNB3Q9ULL4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNB3Q9ULL4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNB3Q9ULL4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNB3Q9ULL4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNB3Q9ULL4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNB3Q9ULL4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNB3Q9ULL4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PLXNB3Q9ULL4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNB3Q9ULL4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNB3Q9ULL4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNB3Q9ULL4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNB3Q9ULL4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNB3Q9ULL4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms