Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HMG20BQ9P0W2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HMG20BQ9P0W2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HMG20BQ9P0W2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HMG20BQ9P0W2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
HMG20BQ9P0W2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HMG20BQ9P0W2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HMG20BQ9P0W2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
HMG20BQ9P0W2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
HMG20BQ9P0W2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
HMG20BQ9P0W2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
HMG20BQ9P0W2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HMG20BQ9P0W2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
HMG20BQ9P0W2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
HMG20BQ9P0W2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HMG20BQ9P0W2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HMG20BQ9P0W2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HMG20BQ9P0W2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMG20BQ9P0W2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
HMG20BQ9P0W2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HMG20BQ9P0W2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HMG20BQ9P0W2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HMG20BQ9P0W2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HMG20BQ9P0W2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HMG20BQ9P0W2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HMG20BQ9P0W2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
HMG20BQ9P0W2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HMG20BQ9P0W2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HMG20BQ9P0W2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
HMG20BQ9P0W2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HMG20BQ9P0W2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMG20BQ9P0W2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMG20BQ9P0W2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HMG20BQ9P0W2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HMG20BQ9P0W2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HMG20BQ9P0W2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
HMG20BQ9P0W2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
HMG20BQ9P0W2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HMG20BQ9P0W2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HMG20BQ9P0W2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
HMG20BQ9P0W2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HMG20BQ9P0W2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HMG20BQ9P0W2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HMG20BQ9P0W2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HMG20BQ9P0W2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
HMG20BQ9P0W2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HMG20BQ9P0W2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HMG20BQ9P0W2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HMG20BQ9P0W2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMG20BQ9P0W2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HMG20BQ9P0W2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HMG20BQ9P0W2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HMG20BQ9P0W2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HMG20BQ9P0W2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HMG20BQ9P0W2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HMG20BQ9P0W2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
HMG20BQ9P0W2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HMG20BQ9P0W2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HMG20BQ9P0W2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HMG20BQ9P0W2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HMG20BQ9P0W2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HMG20BQ9P0W2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HMG20BQ9P0W2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HMG20BQ9P0W2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HMG20BQ9P0W2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HMG20BQ9P0W2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HMG20BQ9P0W2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
HMG20BQ9P0W2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HMG20BQ9P0W2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HMG20BQ9P0W2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HMG20BQ9P0W2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HMG20BQ9P0W2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HMG20BQ9P0W2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HMG20BQ9P0W2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HMG20BQ9P0W2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HMG20BQ9P0W2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
HMG20BQ9P0W2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HMG20BQ9P0W2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
HMG20BQ9P0W2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HMG20BQ9P0W2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
HMG20BQ9P0W2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HMG20BQ9P0W2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HMG20BQ9P0W2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HMG20BQ9P0W2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HMG20BQ9P0W2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HMG20BQ9P0W2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
HMG20BQ9P0W2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HMG20BQ9P0W2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMG20BQ9P0W2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMG20BQ9P0W2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMG20BQ9P0W2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMG20BQ9P0W2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMG20BQ9P0W2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMG20BQ9P0W2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
HMG20BQ9P0W2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMG20BQ9P0W2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMG20BQ9P0W2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HMG20BQ9P0W2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HMG20BQ9P0W2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HMG20BQ9P0W2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms