Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNIP1Q9NZI2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNIP1Q9NZI2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNIP1Q9NZI2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNIP1Q9NZI2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNIP1Q9NZI2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNIP1Q9NZI2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNIP1Q9NZI2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNIP1Q9NZI2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNIP1Q9NZI2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNIP1Q9NZI2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNIP1Q9NZI2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNIP1Q9NZI2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNIP1Q9NZI2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNIP1Q9NZI2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNIP1Q9NZI2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNIP1Q9NZI2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNIP1Q9NZI2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNIP1Q9NZI2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNIP1Q9NZI2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNIP1Q9NZI2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNIP1Q9NZI2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNIP1Q9NZI2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNIP1Q9NZI2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNIP1Q9NZI2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNIP1Q9NZI2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNIP1Q9NZI2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNIP1Q9NZI2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNIP1Q9NZI2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNIP1Q9NZI2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNIP1Q9NZI2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNIP1Q9NZI2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNIP1Q9NZI2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNIP1Q9NZI2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNIP1Q9NZI2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNIP1Q9NZI2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNIP1Q9NZI2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNIP1Q9NZI2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNIP1Q9NZI2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNIP1Q9NZI2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNIP1Q9NZI2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNIP1Q9NZI2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNIP1Q9NZI2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNIP1Q9NZI2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNIP1Q9NZI2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNIP1Q9NZI2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNIP1Q9NZI2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNIP1Q9NZI2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNIP1Q9NZI2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNIP1Q9NZI2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNIP1Q9NZI2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNIP1Q9NZI2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNIP1Q9NZI2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNIP1Q9NZI2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNIP1Q9NZI2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNIP1Q9NZI2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNIP1Q9NZI2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNIP1Q9NZI2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNIP1Q9NZI2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNIP1Q9NZI2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNIP1Q9NZI2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNIP1Q9NZI2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNIP1Q9NZI2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNIP1Q9NZI2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNIP1Q9NZI2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNIP1Q9NZI2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNIP1Q9NZI2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNIP1Q9NZI2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNIP1Q9NZI2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNIP1Q9NZI2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNIP1Q9NZI2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNIP1Q9NZI2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNIP1Q9NZI2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNIP1Q9NZI2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNIP1Q9NZI2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNIP1Q9NZI2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNIP1Q9NZI2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNIP1Q9NZI2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNIP1Q9NZI2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNIP1Q9NZI2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNIP1Q9NZI2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNIP1Q9NZI2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNIP1Q9NZI2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNIP1Q9NZI2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNIP1Q9NZI2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNIP1Q9NZI2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNIP1Q9NZI2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNIP1Q9NZI2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNIP1Q9NZI2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNIP1Q9NZI2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNIP1Q9NZI2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNIP1Q9NZI2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNIP1Q9NZI2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNIP1Q9NZI2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNIP1Q9NZI2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNIP1Q9NZI2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNIP1Q9NZI2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms