Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKIRAS2Q9NYR9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKIRAS2Q9NYR9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKIRAS2Q9NYR9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKIRAS2Q9NYR9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKIRAS2Q9NYR9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKIRAS2Q9NYR9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKIRAS2Q9NYR9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKIRAS2Q9NYR9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKIRAS2Q9NYR9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKIRAS2Q9NYR9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKIRAS2Q9NYR9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKIRAS2Q9NYR9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKIRAS2Q9NYR9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKIRAS2Q9NYR9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKIRAS2Q9NYR9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKIRAS2Q9NYR9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKIRAS2Q9NYR9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKIRAS2Q9NYR9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKIRAS2Q9NYR9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKIRAS2Q9NYR9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKIRAS2Q9NYR9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKIRAS2Q9NYR9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKIRAS2Q9NYR9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKIRAS2Q9NYR9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKIRAS2Q9NYR9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKIRAS2Q9NYR9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NKIRAS2Q9NYR9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKIRAS2Q9NYR9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKIRAS2Q9NYR9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKIRAS2Q9NYR9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NKIRAS2Q9NYR9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NKIRAS2Q9NYR9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKIRAS2Q9NYR9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKIRAS2Q9NYR9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKIRAS2Q9NYR9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKIRAS2Q9NYR9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKIRAS2Q9NYR9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKIRAS2Q9NYR9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKIRAS2Q9NYR9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKIRAS2Q9NYR9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKIRAS2Q9NYR9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKIRAS2Q9NYR9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKIRAS2Q9NYR9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKIRAS2Q9NYR9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKIRAS2Q9NYR9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKIRAS2Q9NYR9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKIRAS2Q9NYR9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKIRAS2Q9NYR9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKIRAS2Q9NYR9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKIRAS2Q9NYR9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKIRAS2Q9NYR9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKIRAS2Q9NYR9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NKIRAS2Q9NYR9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NKIRAS2Q9NYR9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKIRAS2Q9NYR9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKIRAS2Q9NYR9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKIRAS2Q9NYR9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKIRAS2Q9NYR9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKIRAS2Q9NYR9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKIRAS2Q9NYR9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKIRAS2Q9NYR9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKIRAS2Q9NYR9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKIRAS2Q9NYR9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKIRAS2Q9NYR9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKIRAS2Q9NYR9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKIRAS2Q9NYR9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKIRAS2Q9NYR9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKIRAS2Q9NYR9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKIRAS2Q9NYR9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKIRAS2Q9NYR9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKIRAS2Q9NYR9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKIRAS2Q9NYR9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKIRAS2Q9NYR9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKIRAS2Q9NYR9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKIRAS2Q9NYR9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKIRAS2Q9NYR9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKIRAS2Q9NYR9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKIRAS2Q9NYR9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKIRAS2Q9NYR9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKIRAS2Q9NYR9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKIRAS2Q9NYR9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKIRAS2Q9NYR9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKIRAS2Q9NYR9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKIRAS2Q9NYR9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NKIRAS2Q9NYR9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKIRAS2Q9NYR9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKIRAS2Q9NYR9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKIRAS2Q9NYR9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKIRAS2Q9NYR9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms