Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TBCCD1Q9NVR7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TBCCD1Q9NVR7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TBCCD1Q9NVR7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TBCCD1Q9NVR7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBCCD1Q9NVR7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBCCD1Q9NVR7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBCCD1Q9NVR7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TBCCD1Q9NVR7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TBCCD1Q9NVR7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TBCCD1Q9NVR7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TBCCD1Q9NVR7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TBCCD1Q9NVR7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TBCCD1Q9NVR7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TBCCD1Q9NVR7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TBCCD1Q9NVR7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TBCCD1Q9NVR7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TBCCD1Q9NVR7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TBCCD1Q9NVR7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TBCCD1Q9NVR7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TBCCD1Q9NVR7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TBCCD1Q9NVR7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms