Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ATP8A2Q9NTI2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ATP8A2Q9NTI2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ATP8A2Q9NTI2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATP8A2Q9NTI2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATP8A2Q9NTI2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ATP8A2Q9NTI2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ATP8A2Q9NTI2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATP8A2Q9NTI2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATP8A2Q9NTI2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP8A2Q9NTI2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ATP8A2Q9NTI2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP8A2Q9NTI2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP8A2Q9NTI2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATP8A2Q9NTI2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP8A2Q9NTI2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP8A2Q9NTI2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP8A2Q9NTI2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP8A2Q9NTI2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP8A2Q9NTI2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP8A2Q9NTI2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP8A2Q9NTI2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP8A2Q9NTI2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATP8A2Q9NTI2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP8A2Q9NTI2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP8A2Q9NTI2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP8A2Q9NTI2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP8A2Q9NTI2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP8A2Q9NTI2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATP8A2Q9NTI2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ATP8A2Q9NTI2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATP8A2Q9NTI2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATP8A2Q9NTI2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP8A2Q9NTI2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP8A2Q9NTI2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP8A2Q9NTI2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP8A2Q9NTI2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP8A2Q9NTI2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP8A2Q9NTI2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP8A2Q9NTI2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP8A2Q9NTI2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP8A2Q9NTI2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP8A2Q9NTI2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP8A2Q9NTI2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATP8A2Q9NTI2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP8A2Q9NTI2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP8A2Q9NTI2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP8A2Q9NTI2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP8A2Q9NTI2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP8A2Q9NTI2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP8A2Q9NTI2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP8A2Q9NTI2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP8A2Q9NTI2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP8A2Q9NTI2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP8A2Q9NTI2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP8A2Q9NTI2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP8A2Q9NTI2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATP8A2Q9NTI2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ATP8A2Q9NTI2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ATP8A2Q9NTI2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATP8A2Q9NTI2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ATP8A2Q9NTI2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATP8A2Q9NTI2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP8A2Q9NTI2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP8A2Q9NTI2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP8A2Q9NTI2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP8A2Q9NTI2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
ATP8A2Q9NTI2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATP8A2Q9NTI2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP8A2Q9NTI2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP8A2Q9NTI2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP8A2Q9NTI2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATP8A2Q9NTI2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP8A2Q9NTI2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATP8A2Q9NTI2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP8A2Q9NTI2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP8A2Q9NTI2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP8A2Q9NTI2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP8A2Q9NTI2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP8A2Q9NTI2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATP8A2Q9NTI2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATP8A2Q9NTI2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP8A2Q9NTI2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP8A2Q9NTI2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP8A2Q9NTI2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP8A2Q9NTI2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP8A2Q9NTI2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP8A2Q9NTI2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP8A2Q9NTI2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP8A2Q9NTI2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP8A2Q9NTI2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP8A2Q9NTI2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP8A2Q9NTI2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATP8A2Q9NTI2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATP8A2Q9NTI2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP8A2Q9NTI2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATP8A2Q9NTI2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP8A2Q9NTI2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms