Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLK4Q9HAZ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLK4Q9HAZ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLK4Q9HAZ1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLK4Q9HAZ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLK4Q9HAZ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLK4Q9HAZ1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLK4Q9HAZ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLK4Q9HAZ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLK4Q9HAZ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLK4Q9HAZ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLK4Q9HAZ1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLK4Q9HAZ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLK4Q9HAZ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLK4Q9HAZ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLK4Q9HAZ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLK4Q9HAZ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLK4Q9HAZ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLK4Q9HAZ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLK4Q9HAZ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLK4Q9HAZ1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLK4Q9HAZ1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLK4Q9HAZ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLK4Q9HAZ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLK4Q9HAZ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLK4Q9HAZ1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CLK4Q9HAZ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLK4Q9HAZ1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLK4Q9HAZ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLK4Q9HAZ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLK4Q9HAZ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLK4Q9HAZ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLK4Q9HAZ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLK4Q9HAZ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLK4Q9HAZ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLK4Q9HAZ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLK4Q9HAZ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLK4Q9HAZ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLK4Q9HAZ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLK4Q9HAZ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLK4Q9HAZ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLK4Q9HAZ1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLK4Q9HAZ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLK4Q9HAZ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLK4Q9HAZ1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLK4Q9HAZ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLK4Q9HAZ1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLK4Q9HAZ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLK4Q9HAZ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLK4Q9HAZ1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLK4Q9HAZ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLK4Q9HAZ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLK4Q9HAZ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLK4Q9HAZ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLK4Q9HAZ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLK4Q9HAZ1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLK4Q9HAZ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLK4Q9HAZ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLK4Q9HAZ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLK4Q9HAZ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK4Q9HAZ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK4Q9HAZ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK4Q9HAZ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK4Q9HAZ1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLK4Q9HAZ1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLK4Q9HAZ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLK4Q9HAZ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLK4Q9HAZ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLK4Q9HAZ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLK4Q9HAZ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLK4Q9HAZ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLK4Q9HAZ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLK4Q9HAZ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLK4Q9HAZ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLK4Q9HAZ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLK4Q9HAZ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLK4Q9HAZ1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLK4Q9HAZ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLK4Q9HAZ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLK4Q9HAZ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLK4Q9HAZ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLK4Q9HAZ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLK4Q9HAZ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLK4Q9HAZ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLK4Q9HAZ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLK4Q9HAZ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLK4Q9HAZ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLK4Q9HAZ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms