Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A6AQ9H2W1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A6AQ9H2W1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6AQ9H2W1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6AQ9H2W1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A6AQ9H2W1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A6AQ9H2W1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A6AQ9H2W1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A6AQ9H2W1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A6AQ9H2W1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A6AQ9H2W1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A6AQ9H2W1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A6AQ9H2W1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6AQ9H2W1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6AQ9H2W1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6AQ9H2W1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6AQ9H2W1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A6AQ9H2W1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6AQ9H2W1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A6AQ9H2W1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6AQ9H2W1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6AQ9H2W1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6AQ9H2W1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A6AQ9H2W1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A6AQ9H2W1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A6AQ9H2W1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6AQ9H2W1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6AQ9H2W1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6AQ9H2W1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6AQ9H2W1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6AQ9H2W1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A6AQ9H2W1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A6AQ9H2W1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6AQ9H2W1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6AQ9H2W1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A6AQ9H2W1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A6AQ9H2W1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A6AQ9H2W1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A6AQ9H2W1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A6AQ9H2W1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MS4A6AQ9H2W1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A6AQ9H2W1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A6AQ9H2W1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A6AQ9H2W1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A6AQ9H2W1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6AQ9H2W1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6AQ9H2W1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A6AQ9H2W1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6AQ9H2W1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6AQ9H2W1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A6AQ9H2W1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A6AQ9H2W1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A6AQ9H2W1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A6AQ9H2W1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A6AQ9H2W1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A6AQ9H2W1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A6AQ9H2W1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A6AQ9H2W1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A6AQ9H2W1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A6AQ9H2W1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A6AQ9H2W1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A6AQ9H2W1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A6AQ9H2W1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MS4A6AQ9H2W1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A6AQ9H2W1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6AQ9H2W1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MS4A6AQ9H2W1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6AQ9H2W1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6AQ9H2W1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A6AQ9H2W1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A6AQ9H2W1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6AQ9H2W1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A6AQ9H2W1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6AQ9H2W1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6AQ9H2W1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A6AQ9H2W1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6AQ9H2W1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6AQ9H2W1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6AQ9H2W1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6AQ9H2W1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A6AQ9H2W1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A6AQ9H2W1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A6AQ9H2W1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A6AQ9H2W1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6AQ9H2W1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6AQ9H2W1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6AQ9H2W1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6AQ9H2W1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms