Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXI9

C1QTNF6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF6Q9BXI9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QTNF6Q9BXI9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF6Q9BXI9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF6Q9BXI9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF6Q9BXI9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF6Q9BXI9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1QTNF6Q9BXI9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1QTNF6Q9BXI9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C1QTNF6Q9BXI9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1QTNF6Q9BXI9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF6Q9BXI9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QTNF6Q9BXI9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1QTNF6Q9BXI9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1QTNF6Q9BXI9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF6Q9BXI9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QTNF6Q9BXI9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QTNF6Q9BXI9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1QTNF6Q9BXI9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QTNF6Q9BXI9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QTNF6Q9BXI9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QTNF6Q9BXI9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QTNF6Q9BXI9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QTNF6Q9BXI9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QTNF6Q9BXI9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QTNF6Q9BXI9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QTNF6Q9BXI9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QTNF6Q9BXI9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QTNF6Q9BXI9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QTNF6Q9BXI9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QTNF6Q9BXI9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF6Q9BXI9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF6Q9BXI9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms