Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BBS2Q9BXC9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BBS2Q9BXC9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BBS2Q9BXC9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BBS2Q9BXC9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BBS2Q9BXC9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BBS2Q9BXC9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BBS2Q9BXC9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
BBS2Q9BXC9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBS2Q9BXC9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBS2Q9BXC9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BBS2Q9BXC9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BBS2Q9BXC9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BBS2Q9BXC9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BBS2Q9BXC9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBS2Q9BXC9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BBS2Q9BXC9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BBS2Q9BXC9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BBS2Q9BXC9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BBS2Q9BXC9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BBS2Q9BXC9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BBS2Q9BXC9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BBS2Q9BXC9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BBS2Q9BXC9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BBS2Q9BXC9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BBS2Q9BXC9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BBS2Q9BXC9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BBS2Q9BXC9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BBS2Q9BXC9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
BBS2Q9BXC9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BBS2Q9BXC9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BBS2Q9BXC9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BBS2Q9BXC9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BBS2Q9BXC9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BBS2Q9BXC9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BBS2Q9BXC9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BBS2Q9BXC9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BBS2Q9BXC9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BBS2Q9BXC9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BBS2Q9BXC9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BBS2Q9BXC9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BBS2Q9BXC9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BBS2Q9BXC9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BBS2Q9BXC9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BBS2Q9BXC9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BBS2Q9BXC9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BBS2Q9BXC9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
BBS2Q9BXC9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BBS2Q9BXC9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BBS2Q9BXC9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BBS2Q9BXC9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BBS2Q9BXC9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BBS2Q9BXC9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BBS2Q9BXC9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BBS2Q9BXC9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BBS2Q9BXC9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BBS2Q9BXC9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BBS2Q9BXC9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BBS2Q9BXC9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BBS2Q9BXC9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BBS2Q9BXC9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BBS2Q9BXC9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BBS2Q9BXC9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BBS2Q9BXC9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BBS2Q9BXC9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BBS2Q9BXC9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BBS2Q9BXC9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BBS2Q9BXC9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BBS2Q9BXC9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BBS2Q9BXC9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BBS2Q9BXC9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BBS2Q9BXC9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BBS2Q9BXC9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BBS2Q9BXC9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BBS2Q9BXC9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BBS2Q9BXC9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BBS2Q9BXC9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BBS2Q9BXC9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BBS2Q9BXC9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BBS2Q9BXC9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BBS2Q9BXC9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
BBS2Q9BXC9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BBS2Q9BXC9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BBS2Q9BXC9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BBS2Q9BXC9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BBS2Q9BXC9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BBS2Q9BXC9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BBS2Q9BXC9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
BBS2Q9BXC9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BBS2Q9BXC9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BBS2Q9BXC9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BBS2Q9BXC9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BBS2Q9BXC9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBS2Q9BXC9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBS2Q9BXC9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BBS2Q9BXC9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BBS2Q9BXC9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BBS2Q9BXC9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBS2Q9BXC9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBS2Q9BXC9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms