Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
STRA6Q9BX79 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
STRA6Q9BX79 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
STRA6Q9BX79 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
STRA6Q9BX79 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
STRA6Q9BX79 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
STRA6Q9BX79 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
STRA6Q9BX79 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
STRA6Q9BX79 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
STRA6Q9BX79 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
STRA6Q9BX79 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
STRA6Q9BX79 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
STRA6Q9BX79 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
STRA6Q9BX79 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRA6Q9BX79 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
STRA6Q9BX79 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
STRA6Q9BX79 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
STRA6Q9BX79 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
STRA6Q9BX79 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
STRA6Q9BX79 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
STRA6Q9BX79 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
STRA6Q9BX79 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
STRA6Q9BX79 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
STRA6Q9BX79 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
STRA6Q9BX79 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
STRA6Q9BX79 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
STRA6Q9BX79 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
STRA6Q9BX79 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
STRA6Q9BX79 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
STRA6Q9BX79 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
STRA6Q9BX79 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
STRA6Q9BX79 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
STRA6Q9BX79 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
STRA6Q9BX79 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
STRA6Q9BX79 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
STRA6Q9BX79 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
STRA6Q9BX79 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
STRA6Q9BX79 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
STRA6Q9BX79 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
STRA6Q9BX79 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
STRA6Q9BX79 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
STRA6Q9BX79 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
STRA6Q9BX79 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
STRA6Q9BX79 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
STRA6Q9BX79 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
STRA6Q9BX79 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
STRA6Q9BX79 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
STRA6Q9BX79 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
STRA6Q9BX79 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
STRA6Q9BX79 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
STRA6Q9BX79 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
STRA6Q9BX79 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
STRA6Q9BX79 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
STRA6Q9BX79 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
STRA6Q9BX79 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
STRA6Q9BX79 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
STRA6Q9BX79 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
STRA6Q9BX79 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
STRA6Q9BX79 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
STRA6Q9BX79 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
STRA6Q9BX79 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
STRA6Q9BX79 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
STRA6Q9BX79 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
STRA6Q9BX79 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
STRA6Q9BX79 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
STRA6Q9BX79 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRA6Q9BX79 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
STRA6Q9BX79 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
STRA6Q9BX79 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
STRA6Q9BX79 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
STRA6Q9BX79 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
STRA6Q9BX79 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
STRA6Q9BX79 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
STRA6Q9BX79 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
STRA6Q9BX79 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
STRA6Q9BX79 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
STRA6Q9BX79 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
STRA6Q9BX79 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STRA6Q9BX79 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
STRA6Q9BX79 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
STRA6Q9BX79 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
STRA6Q9BX79 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
STRA6Q9BX79 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
STRA6Q9BX79 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
STRA6Q9BX79 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRA6Q9BX79 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
STRA6Q9BX79 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
STRA6Q9BX79 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
STRA6Q9BX79 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
STRA6Q9BX79 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STRA6Q9BX79 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
STRA6Q9BX79 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
STRA6Q9BX79 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
STRA6Q9BX79 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
STRA6Q9BX79 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
STRA6Q9BX79 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
STRA6Q9BX79 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
STRA6Q9BX79 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
STRA6Q9BX79 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
STRA6Q9BX79 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms