Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD5Q9BSY4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD5Q9BSY4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD5Q9BSY4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD5Q9BSY4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD5Q9BSY4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD5Q9BSY4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD5Q9BSY4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD5Q9BSY4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHCHD5Q9BSY4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD5Q9BSY4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD5Q9BSY4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD5Q9BSY4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD5Q9BSY4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD5Q9BSY4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD5Q9BSY4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD5Q9BSY4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD5Q9BSY4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD5Q9BSY4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD5Q9BSY4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD5Q9BSY4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD5Q9BSY4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD5Q9BSY4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD5Q9BSY4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD5Q9BSY4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD5Q9BSY4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD5Q9BSY4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD5Q9BSY4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD5Q9BSY4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD5Q9BSY4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD5Q9BSY4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD5Q9BSY4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD5Q9BSY4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD5Q9BSY4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD5Q9BSY4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD5Q9BSY4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD5Q9BSY4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD5Q9BSY4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD5Q9BSY4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD5Q9BSY4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD5Q9BSY4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD5Q9BSY4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD5Q9BSY4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD5Q9BSY4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD5Q9BSY4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD5Q9BSY4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD5Q9BSY4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD5Q9BSY4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD5Q9BSY4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD5Q9BSY4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD5Q9BSY4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD5Q9BSY4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD5Q9BSY4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHCHD5Q9BSY4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD5Q9BSY4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD5Q9BSY4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD5Q9BSY4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD5Q9BSY4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD5Q9BSY4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD5Q9BSY4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD5Q9BSY4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD5Q9BSY4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD5Q9BSY4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD5Q9BSY4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD5Q9BSY4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD5Q9BSY4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD5Q9BSY4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD5Q9BSY4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD5Q9BSY4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD5Q9BSY4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD5Q9BSY4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD5Q9BSY4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD5Q9BSY4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD5Q9BSY4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD5Q9BSY4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD5Q9BSY4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD5Q9BSY4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD5Q9BSY4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD5Q9BSY4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD5Q9BSY4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD5Q9BSY4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD5Q9BSY4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHCHD5Q9BSY4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD5Q9BSY4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHCHD5Q9BSY4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD5Q9BSY4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHCHD5Q9BSY4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD5Q9BSY4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms