Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM44Q96DX7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM44Q96DX7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM44Q96DX7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM44Q96DX7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM44Q96DX7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM44Q96DX7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRIM44Q96DX7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRIM44Q96DX7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRIM44Q96DX7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRIM44Q96DX7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRIM44Q96DX7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRIM44Q96DX7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRIM44Q96DX7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRIM44Q96DX7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRIM44Q96DX7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM44Q96DX7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM44Q96DX7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM44Q96DX7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM44Q96DX7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM44Q96DX7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM44Q96DX7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM44Q96DX7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM44Q96DX7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM44Q96DX7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRIM44Q96DX7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRIM44Q96DX7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRIM44Q96DX7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRIM44Q96DX7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRIM44Q96DX7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM44Q96DX7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRIM44Q96DX7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM44Q96DX7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM44Q96DX7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM44Q96DX7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM44Q96DX7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM44Q96DX7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM44Q96DX7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM44Q96DX7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM44Q96DX7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRIM44Q96DX7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRIM44Q96DX7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TRIM44Q96DX7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRIM44Q96DX7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRIM44Q96DX7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRIM44Q96DX7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRIM44Q96DX7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRIM44Q96DX7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM44Q96DX7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM44Q96DX7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM44Q96DX7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM44Q96DX7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM44Q96DX7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM44Q96DX7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM44Q96DX7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TRIM44Q96DX7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRIM44Q96DX7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM44Q96DX7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIM44Q96DX7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRIM44Q96DX7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM44Q96DX7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM44Q96DX7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM44Q96DX7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM44Q96DX7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM44Q96DX7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM44Q96DX7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM44Q96DX7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM44Q96DX7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM44Q96DX7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM44Q96DX7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM44Q96DX7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRIM44Q96DX7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRIM44Q96DX7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM44Q96DX7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM44Q96DX7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRIM44Q96DX7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRIM44Q96DX7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRIM44Q96DX7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRIM44Q96DX7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRIM44Q96DX7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TRIM44Q96DX7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRIM44Q96DX7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRIM44Q96DX7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRIM44Q96DX7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRIM44Q96DX7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRIM44Q96DX7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRIM44Q96DX7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRIM44Q96DX7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRIM44Q96DX7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRIM44Q96DX7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRIM44Q96DX7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TRIM44Q96DX7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRIM44Q96DX7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRIM44Q96DX7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRIM44Q96DX7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TRIM44Q96DX7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRIM44Q96DX7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRIM44Q96DX7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRIM44Q96DX7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRIM44Q96DX7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms