Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB39BQ96DA2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB39BQ96DA2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB39BQ96DA2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB39BQ96DA2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB39BQ96DA2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB39BQ96DA2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB39BQ96DA2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB39BQ96DA2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB39BQ96DA2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB39BQ96DA2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB39BQ96DA2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB39BQ96DA2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB39BQ96DA2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB39BQ96DA2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB39BQ96DA2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB39BQ96DA2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB39BQ96DA2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB39BQ96DA2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB39BQ96DA2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB39BQ96DA2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB39BQ96DA2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB39BQ96DA2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB39BQ96DA2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB39BQ96DA2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB39BQ96DA2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB39BQ96DA2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB39BQ96DA2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB39BQ96DA2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB39BQ96DA2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB39BQ96DA2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB39BQ96DA2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB39BQ96DA2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB39BQ96DA2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB39BQ96DA2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB39BQ96DA2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB39BQ96DA2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB39BQ96DA2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB39BQ96DA2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB39BQ96DA2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB39BQ96DA2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB39BQ96DA2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB39BQ96DA2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB39BQ96DA2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB39BQ96DA2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB39BQ96DA2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB39BQ96DA2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB39BQ96DA2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB39BQ96DA2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB39BQ96DA2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB39BQ96DA2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB39BQ96DA2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB39BQ96DA2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB39BQ96DA2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB39BQ96DA2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB39BQ96DA2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB39BQ96DA2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB39BQ96DA2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB39BQ96DA2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB39BQ96DA2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB39BQ96DA2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB39BQ96DA2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB39BQ96DA2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB39BQ96DA2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB39BQ96DA2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB39BQ96DA2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB39BQ96DA2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB39BQ96DA2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB39BQ96DA2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB39BQ96DA2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB39BQ96DA2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB39BQ96DA2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB39BQ96DA2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB39BQ96DA2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB39BQ96DA2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB39BQ96DA2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB39BQ96DA2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB39BQ96DA2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB39BQ96DA2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB39BQ96DA2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB39BQ96DA2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB39BQ96DA2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB39BQ96DA2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB39BQ96DA2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB39BQ96DA2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB39BQ96DA2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB39BQ96DA2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB39BQ96DA2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB39BQ96DA2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB39BQ96DA2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB39BQ96DA2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB39BQ96DA2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB39BQ96DA2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB39BQ96DA2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB39BQ96DA2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB39BQ96DA2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB39BQ96DA2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB39BQ96DA2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB39BQ96DA2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB39BQ96DA2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 307.1 ms