Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP7Q93009 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP7Q93009 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP7Q93009 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP7Q93009 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP7Q93009 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP7Q93009 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP7Q93009 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP7Q93009 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP7Q93009 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP7Q93009 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP7Q93009 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP7Q93009 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP7Q93009 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP7Q93009 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP7Q93009 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP7Q93009 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP7Q93009 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP7Q93009 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP7Q93009 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP7Q93009 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP7Q93009 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP7Q93009 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP7Q93009 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP7Q93009 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP7Q93009 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP7Q93009 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP7Q93009 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP7Q93009 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP7Q93009 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP7Q93009 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP7Q93009 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP7Q93009 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP7Q93009 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP7Q93009 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP7Q93009 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP7Q93009 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP7Q93009 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP7Q93009 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP7Q93009 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP7Q93009 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP7Q93009 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP7Q93009 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP7Q93009 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP7Q93009 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP7Q93009 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP7Q93009 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP7Q93009 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP7Q93009 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP7Q93009 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP7Q93009 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP7Q93009 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP7Q93009 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP7Q93009 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP7Q93009 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP7Q93009 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP7Q93009 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP7Q93009 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP7Q93009 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP7Q93009 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP7Q93009 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP7Q93009 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP7Q93009 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP7Q93009 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP7Q93009 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP7Q93009 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP7Q93009 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP7Q93009 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP7Q93009 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP7Q93009 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP7Q93009 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP7Q93009 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP7Q93009 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP7Q93009 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP7Q93009 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP7Q93009 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP7Q93009 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP7Q93009 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP7Q93009 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP7Q93009 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP7Q93009 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP7Q93009 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP7Q93009 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP7Q93009 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP7Q93009 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP7Q93009 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP7Q93009 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP7Q93009 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP7Q93009 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP7Q93009 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP7Q93009 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP7Q93009 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP7Q93009 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP7Q93009 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP7Q93009 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP7Q93009 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP7Q93009 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP7Q93009 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP7Q93009 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP7Q93009 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms